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biostar handbook(七)| BLAST

Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda bl
徐洲更 8年前 1036

这或许是我写的最全的BLAST教程

Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda bl
徐洲更 8年前 1822

基因功能注释

基因功能的注释依赖于上一步的基因结构预测，根据预测结果从基因组上提取翻译后的 蛋白序列 和主流的数据库进行比对，完成功能注释。常用数据库一共有以几种： Nr：NCBI官方非冗余蛋白数据库，包括PDB, Swiss-Prot, PIR, PRF; 如果要用DN
徐洲更 7年前 1238

如何对基因组序列进行注释

基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction)：通过已有的概率模型来预测基因结构，在预测剪切位点和UTR区准确性较低 同源预测(
徐洲更 7年前 4101

应该是最好的eggnog-mapper功能注释教程

eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因，常见的方法就是BLAST+BLAST2GO， 或者是InterProScan。eggNOG-mapper的作者认为这种方法不够可靠，毕
徐洲更 7年前 2664

ORA-03135: connection lost contact的解决方法

现象: 自从搭建了remote standby之后,每天都会收到primary的alert.log的报警邮件 ,内容是ORA-03135: connection lost contact.查看了错误发生的时间,在夜间两点.其余时间没有这个错误信息.以下分别是
苍雪明南 8年前 3162

RNA-seq常用命令（无参）

0.前期准备 先在工作目录下创建以下几个目录： 01.raw_data #用于存放原始数据 02.fastq #用于存放fastq格式数据 03.fastqc #用于存放QC结果 04.trinity_result #用于存放trinity结果 数据处理的顺
卖萌哥、 7年前 1366

MySQL 8.0.2复制新特性抢鲜看

MySQL 8 正在变得原来越好，而且这也在我们MySQL复制研发团队引起了一阵热潮。我们一直致力于全面提升MySQL复制，通过引入新的和一些有趣的功能。此外，我们还听取了社区的建议和反馈。因此，我们很荣幸能够与你一同见证最新版本（MySQL 8.0.2）的
技术小能手 8年前 2445

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