pdb蛋白数据库

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基因功能注释

基因功能的注释依赖于上一步的基因结构预测，根据预测结果从基因组上提取翻译后的 蛋白序列 和主流的数据库进行比对，完成功能注释。常用数据库一共有以几种： Nr：NCBI官方非冗余蛋白数据库，包括PDB, Swiss-Prot, PIR, PRF; 如果要用DN
徐洲更 6年前 1238

biostar handbook(四)|生物数据及其下载和基本操作

2017/11/9 第一版： 生物数据库，基本数据类型（genbank， fasta/fastq），数据上传站点 2017/11/12 第二版：如何利用esearch, efecth快速获取SRR序列号 生物数据库 目前绝大部分数据由NCBI, EMBL-E
徐洲更 7年前 1571

如何对基因组序列进行注释

基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction)：通过已有的概率模型来预测基因结构，在预测剪切位点和UTR区准确性较低 同源预测(
徐洲更 6年前 4101

《大数据原理：复杂信息的准备、共享和分析》一一2.3　注册唯一对象标识符

2.3　注册唯一对象标识符 唯一性是每个人都能完全理解的概念，似乎没有解释的必要。实际上，计算科学所指的唯一性与自然世界的唯一性有些不同。在计算科学中，唯一性是指一个数据对象与一个唯一的标识符一一对应（即一个数据对象的标识符不会被分配给任何其他数据对象）。我
华章计算机 7年前 1456

每日文献：2018-01-04

mTM-aligin: an algorithm for fast and accurate multiple protein structure alignment 蛋白结构在进化中更加保守，因此根据多个结构进行比对比仅仅依赖于多重序列联配(MSA)更加有
徐洲更 6年前 744

新冠病毒破解有了巨大突破，达摩院做了什么？

​阿里巴巴达摩院正在用AI算法抗击新型冠状病毒肺炎疫情。2月1日，浙江省疾控中心上线自动化的全基因组检测分析平台。利用阿里达摩院研发的AI算法，可将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时，大幅缩短确诊时间，并能精准检测出病毒的变异情况。 达摩院算法专家顾斐
檸，铮 4年前 1687

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阿里巴巴达摩院正在用AI算法抗击新型冠状病毒肺炎疫情。2月1日，浙江省疾控中心上线自动化的全基因组检测分析平台。利用阿里达摩院研发的AI算法，可将原来数小时的疑似病例基因分析缩短至半小时，大幅缩短确诊时间，并能精准检测出病毒的变异情况。 达摩院算法专家顾斐博
祥栖 4年前 5070

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