基因组分析软件

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计费概述

本文介绍基因分析平台的计费模式、计费项、关联的其他云产品费用。概述 基因分析平台是阿里云托管的,完全Serverless化的基因计算服务。无需提前创建和管理任何集群,所有资源完全弹性按需,支持从0到千万的任意样本规模,且只需要为实际...

服务等级协议

本服务等级协议(Service Level Agreement,以下简称“SLA”)规定了阿里云向客户提供的基因分析平台(简称“平台”)的服务可用性等级指标及补偿方案。1.定 义 1.1 服务周期:一个服务周期为一个自然月。1.2 服务周期总分钟数:服务周期内...

软件概述

软件列表 名称 版本 简介 需要选中的依赖包 ABySS 2.1.5 基于短序列的基因组双端组装工具,多节点并行版本。Intel-MPI 2018 Anaconda 2018.12-py27 2018.12-py37 Python环境管理工具。无 BLAST 2.8.1 在生物信息数据库中进行相似性比较的...

VPC流量分析

VPC流日志开启流量分析后,流量分析器会自动开始分析VPC流量信息并生成流量分析图表,帮助您实时监测VPC网络用量和VPC网络运行状况,您可以查看指定时间段内的VPC流量...也可先从二元组分析目标流量区间,再从具体的二元组下钻五元组分析

小Q问数概述

小Q问数使用户能够通过自然语言交互,直接获取数据结果,实现数据即问即答,人人都可上手分析数据,牵引数据消费新方式。重要 小Q问数属于 增值 模块,需要额外购买。仅高级版和专业版支持小Q问数,个人版不支持。若您需要将小Q问数嵌入到...

字符串上传格式与分析说明

4 分析方式 说明 字符串组分析方式共分为两种:单一值:其含义为将上报字符串组内的每一个单一值进行拆解后再分析,例如上文中所描述的['坚果','零食','加工食品'],单一值即表示“坚果”、“零食”、“加工食品”,可针对其中某一个值进行...

基因分析平台

基因数据分析一站式平台,遵循GA4GH行业标准,提供超大规模基因计算引擎和数据应用开放服务。端到端解决用户基因数据传输、存储、管理和生信分析问题,安全可靠、弹性敏捷、经济高效。

集群镜像

您可以安装自己需要的其他应用程序,如用于渲染的 Maya 软件基因数据分析工具等。3.3.创建镜像 请按如下步骤完成镜像创建:待所有程序安装完成后,在 ECS 控制台创建磁盘快照。参考 创建快照;待上述快照创建完成后,在 ECS 控制台创建自...

基因实体表格

本文介绍基因分析平台中的实体概念,以及如何通过表格管理基因数据文件和元数据信息。基因实体表格介绍 基因数据除测序文件(如FASTQ,BAM等)外,还需要包括临床、样本、实验等相关元数据信息,这些组合在一起,才能形成生物医学多学的...

产品优势

阿里云基因分析平台是由阿里云完全托管,专门服务于基因测序行业的公有云产品。与传统的HPC集相比,无需前期投入,即可享有云计算敏捷灵活、按需付费和超大规模的优势。并且产品围绕基因行业的数据和应用特点,开发了众多专业能力,降低...

基因分析应用

基因数据分析工作,需要用户使用不同的生物信息学工具软件,进行一系列复杂的计算过程,才能得到最终的分析结果。以遗传病的数据分析举例,需要进行数据质控、序列比对、变异检测和变异注释等多个步骤。图1:基因数据分析流程(来源/《中华...

什么是弹性高性能计算E-HPC

生命科学 生物信息学:使用E-HPC对大量生物基因组进行测序等处理,从而获取基因组信息和数据分析结果,来解决生物和医学领域的难题。动力学模拟:使用E-HPC进行大规模的分子动力模拟,来预测分析生物蛋白质分子、脂质分子间的相互作用和...

CPFS并行文件存储

可适用于自动驾驶模型训练、基因组测序数据组装和石油勘探业务分析等场景。产品优势 优势 说明 混合云存储架构 集成公共云存储服务,为Cloud Bursting场景下的客户提供优质的体验。高可扩展性 CPFS并行文件存储 集群最大规模可扩展至16384...

入门概述

使用平台提供的公共数据,如常见的物种参考基因组和索引文件。基因应用配置。用户直接使用平台提供的众多公共应用。从头创建自己的基因分析应用。提交运行任务 用户指定基因应用,及其输入文件和运行参数,提交运行任务,由平台自动执行 ...

使用限制

本文介绍基因分析平台功能相关的一些限制,以便您更好地使用。可用地域 基因分析平台支持的地域如下表所示,用户只能在可用地域内创建工作空间用于基因数据的管理和分析工作。地域 备注 华北2(北京)cn-beijing 华南1(深圳)cn-shenzhen ...

应用场景

基因分析平台广泛用于基因数据从样本到报告的分析过程。典型应用场景包括基因数据分析、测序生产自动化和基因云平台开发等。基因数据分析 为任意规模用户,提供开箱即用的基因分析服务,效率高,成本低,灵活可靠,最快30分钟即可获取海量...

功能特性

极速型NAS CPFS 100MB/s基线 CPFS的细分存储类型,适用HPC高性能计算、AI训练、自动驾驶、基因计算、影视渲染、EDA仿真、油气勘探、气象分析等高吞吐、高IOPS、海量文件的IO密集型业务。CPFS存储规格 200MB/s基线 CPFS的细分存储类型,适用...

AliyunEasyGeneFullAccess

AliyunEasyGeneFullAccess 是阿里云管理的产品系统策略,您可以将 AliyunEasyGeneFullAccess 授权给 RAM 身份(RAM 用户、RAM 用户和 RAM 角色),本策略定义了 管理基因分析平台服务(Genomics Computing Platform)的权限。策略详情 ...

AliyunEasyGeneReadOnlyAccess

AliyunEasyGeneReadOnlyAccess 是阿里云管理的产品系统策略,您可以将 AliyunEasyGeneReadOnlyAccess 授权给 RAM 身份(RAM 用户、RAM 用户和 RAM 角色),本策略定义了 只读管理基因分析平台(Genomics Computing Platform)的权限。...

基本概念

应用/App 基因分析应用,使用流程描述语言(如 Workflow Description Language,WDL)编写的标准的、参数化的生物信息分析流程,清晰定义了分析的输入输出、运行环境和软件依赖等,通常包含多个具有依赖关系的分析步骤。平台提供中心化的...

产品公告

本文介绍基因分析平台产品通知公告和活动信息。新特性通知 基因分析平台目前正式公测上线,为所有新用户提供按量付费7折的优惠活动,生效时间 从2021年6月1日开始到2021年11月31日结束。优惠后的产品定价信息如下:计费项 说明 公测优惠...

查看消费明细

本文介绍基因分析平台相关的费用账单和消费明细。操作步骤 登录阿里云 管理控制台。单击顶部导航栏的“费用”,进入费用与成本。在左侧导航栏根据需要,单击不同的标签页,查看消费情况。说明 按量付费资源,从资源使用到计费出账有一定...

发起问数

Quick BI支持 小Q问数 功能,通过智能数据助手小Q,结合ChatBI的智能交互能力,让用户通过自然语言的交互,直接获取数据结果,实现数据即问即答,人人都可上手分析数据,牵引数据消费新方式。您可以在 PC端 或 移动端 的小Q问数对话界面 ...

统计分析

统计分析用于帮助企业了解整体生产环境下事件的运行趋势,可以查看全局、服务、个人事件的统计数据,包括各等级的事件数量、总数量、总(MTTA、MTTR)、整体完结率等核心指标。企业运维一线、管理者均可通过此统计分析报表进行运营分析,...

设置运行时属性

本文介绍基因分析平台支持的运行时属性,并比较阿里云与其他计算后端的差别。基因分析平台目前使用WDL作为分析应用标准,用户可以通过每个Task中的runtime来定义计算作业所需要消耗的平台资源。平台支持的运行时属性 重要 基因分析平台运行...

Quick BI v5.2版本说明

发布日期 2024年7月23日 重点升级概览 仪表板 图表:多维分析表、趋势分析表支持设置默认截止日期为T-0。控件:支持为时间查询控件中的时间粒度,配置基于昨日的本月、本周、本季度的快捷区间。交互式分析:进行图表跳转配置时,支持在全局...

API概览

ListDoctorHDFSUGI 批量获取属主或属HDFS分析结果 通过EMR Doctor批量获取属主或者属的HDFS分析结果。ListDoctorHBaseTables 批量获取 HBase Table 信息 批量获取 HBase Table 信息。ListDoctorHBaseRegionServers 批量获取 HBase ...

指标拆解树

例如,指标拆解树可以方便的查看多个维度中的各个成员对整体的贡献,您也可以将度量值分解至一个或多个分析每个组的数据情况。本文为您介绍如何为指标拆解树添加数据并配置样式。图表概述 使用场景 多用于将一个值分解至多个组,判断多...

包年包月资源隔离

基于配额规划,新增配额,设置数据仓库生产配额、数据仓库开发配额、算法生产配额、算法开发配额、运营分析配额。操作详情请参见 配置Quota。将项目关联对应的配额,新购买的默认预付费Quota不自动关联项目,需手动配置。...

解密AnalyticDB高效基因检测系统

基因匹配结果 如 基因匹配结果 所示,AnalyticDB高效基因检测系统从病毒库检测返回三个基因组(NC_045512.2,NC_019843.3和NC_038294.1)。其中NC_045512.2(占比65%)是武汉海鲜市场的新冠肺炎病毒的基因;NC_019843.3(占比20%)是MERS...

创建运行任务

本文介绍如何在工作空间中,使用基因应用创建运行任务。步骤一:选择应用版本 在工作空间的应用配置中,浏览基因分析应用,点击“运行”。步骤二:设置运行选项 点击应用版本选择框,可选择应用相应版本或标签。Call-Caching:是否复用此前...

授权信息

本文为您介绍 基因分析平台(Genomics)为RAM权限策略定义的操作(Action)、资源(Resource)和条件(Condition)。基因分析平台(Genomics)的RAM代码(RamCode)为 easygene,支持的授权粒度为 RESOURCE。权限策略通用结构 权限策略支持...

基因分析平台的审计事件

基因分析平台已与操作审计服务集成,您可以在操作审计中查询用户操作基因分析平台产生的管控事件。操作审计支持将管控事件投递到日志服务SLS的LogStore或对象存储OSS的存储空间中,满足实时审计、问题回溯分析等需求。操作审计记录了用户...

ListAuthorizedSoftware-获取第三方软件列表

SoftwareName string 软件名称 sentieon SoftwareLongName string 软件长名称 Sentieon加速软件 SoftwareDescription string 软件描述 NGS数据二级分析软件,提供基于CPU的加速方案,可替代BWA,GATK,HaplotypeCaller,Mutect和Mutect2等...

API概览

本产品(基因分析平台/2021-03-15)的OpenAPI采用 RPC 签名风格,签名细节参见 签名机制说明。我们已经为开发者封装了常见编程语言的SDK,开发者可通过 下载SDK 直接调用本产品OpenAPI而无需关心技术细节。如果现有SDK不能满足使用需求,可...

应用场景

基因数据分析中将基因序列对齐,将所有染色体并行做变异分析,最终将各染色体数据聚合产出结果。云工作流 根据指定的依赖关系提交不同CPU、内存、带宽规格的批量计算作业,提升执行可靠性,提高资源利用率,优化成本。数据处理流水线 ...

CreateEntity-创建实体表格

接口说明 请确保在使用该接口前,已充分了解基因分析平台产品的收费方式和价格。调试 您可以在OpenAPI Explorer中直接运行该接口,免去您计算签名的困扰。运行成功后,OpenAPI Explorer可以自动生成SDK代码示例。调试 授权信息 下表是API...

Quick BI v5.0.3版本说明

数据门户协同授权支持在父级节点配置无权限用户隐藏菜单入口,原「菜单入口仅授权用户可见」更名为「无权限用户隐藏菜单入口」血缘分析支持在图分析模式下导出血缘关系。用户管理能力提升 在办公软件同步用户时,支持一键更新组织架构。...

创建用户

一、功能概述 Quick BI 中的“用户”功能允许管理员根据组织成员的部门(如销售部、运营部)或角色(如分析师、项目经理)创建不同的用户,便于对具有相同属性或职责的用户进行统一管理和权限分配。一个用户可以同时属于多个用户,...

创建用户

为了方便对不同的组织成员批量设置权限,您可以根据组织成员的部门(销售部、运营部、技术部等)或组织成员的角色(分析师、项目经理、项目总监等),来创建不同的用户(同一成员可以在多个用户中)。前提条件 已添加用户,请参见 添加...
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