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blast数据库 相关的博客

biostar handbook(七)| BLAST

Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda bl
徐洲更 7年前 1036

这或许是我写的最全的BLAST教程

Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda bl
徐洲更 7年前 1822

基因功能注释

基因功能的注释依赖于上一步的基因结构预测，根据预测结果从基因组上提取翻译后的 蛋白序列 和主流的数据库进行比对，完成功能注释。常用数据库一共有以几种： Nr：NCBI官方非冗余蛋白数据库，包括PDB, Swiss-Prot, PIR, PRF; 如果要用DN
徐洲更 6年前 1238

如何对基因组序列进行注释

基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction)：通过已有的概率模型来预测基因结构，在预测剪切位点和UTR区准确性较低 同源预测(
徐洲更 6年前 4101

应该是最好的eggnog-mapper功能注释教程

eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因，常见的方法就是BLAST+BLAST2GO， 或者是InterProScan。eggNOG-mapper的作者认为这种方法不够可靠，毕
徐洲更 6年前 2664

《Clojure数据分析秘笈》——2.11节解析自定义数据格式

本节书摘来自华章社区《Clojure数据分析秘笈》一书中的第2章，第2.11节解析自定义数据格式，作者（美）Eric Rochester，更多章节内容可以访问云栖社区“华章社区”公众号查看 2.11　解析自定义数据格式 如果你处理的数据足够长，你最终会遇到没
华章计算机 7年前 972

Oracle错误——ORA-03113:在通信信道文件的末尾 解决方案

起源 今天跟往常一样，登陆PL/SQL，确登陆失败，出现一个错误“ORA-01034”和“ORA-27101”如图： 然后就就通过命令提示符去登陆Oracle，去查看怎么回事，然后问题进一步出现。错误“ORA-03113:通信通道的文件结尾进程 ID:6320
eddie小英俊 7年前 1125

阿里云提供高效基因序列检索功能，助力冠状病毒序列快速分析

1.背景介绍 2019年年底，中国的新兴的商业中心武汉，爆发了一种新型的冠状病毒，在流行的两个多月中，在中国造成了3300多人死亡，8万2千多人感染。随着疫情的进一步蔓延，目前已经横跨了109个国家，造成了80多万人感染，4万多人失去了生命。到目前为止，疫情
Roin123 4年前 697

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