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tcga 临床数据库 相关的博客
癌症基因组图谱TCGA计划,历时8年宣告完成
旨在绘制出1万个肿瘤基因组景观图谱的美国重大科研项目——“癌症基因组图集”(The Cancer Genome Atlas,TCGA)计划已正式宣告结束。这一于2006年启动,耗资1亿美元,现在是国际肿瘤基因组协作组(International Cancer
小旋风柴进
7年前
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文献翻译Complex integrated analysis of lncRNAs-miRNAs-mRNAs in oral squamous cell carcinoma(2)
材料和方法 获取微阵列数据和选择数据集头颈部鳞状细胞癌的基因表达数据 (HNSCC)从Cancer Genome Atlas下载(TCGA)数据库(https://gdc-portal.nci.nih.gov/)。根据口腔的解剖学定义,387个口腔样本(33
夜神moon
6年前
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个性化癌症治疗:综合的基因组分析方法及其在临床的应用
◆ ◆ ◆ 背景 近期,随着癌症基础研究的不断进步,癌症诊断技术的日新月异,以及更多针对性治疗手段的增加,个性化治疗突飞猛进,为治愈癌症提供了最好的保障。 ◆ ◆ ◆ 方法 我们通过综合的基因组数据分析,来精确预测每个肿瘤的复杂性,从而开发出适合临床环境的个性
小旋风柴进
7年前
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个性化癌症治疗:综合的基因组分析方法及其在临床的应用|论文下载+作者线上分享报名
#大数据文摘很荣幸的邀请到本文作者,纽约西奈山医学院教授、临床基因检测信息部主任陈荣与各位读者分享相关研究。扫描文末二维码加入大数据文摘“未来医疗与大数据”微信群参与。 编者注:个性化治疗突飞猛进,正在为治愈癌症提供最好的保障。综合的基因组分析方法如何助力个性
小旋风柴进
7年前
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“精确医学”须谨慎解读
【编者按 美国于2015年年初提出的“精确医学”计划倍受世界各国关注。有消息称,我国的相关计划将在今年下半年或明年启动。对此,中科院上海生命科学研究院吴家睿研究员近期撰文指出,“精确医学”是一个有着丰富内涵的复杂概念,需要人们认真地思考和小心地解读。当前,亟
小旋风柴进
7年前
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Unsupervised clustering reveals new prostate cancer subtypes
摘要 背景:前列腺癌是男性中第二常见的癌症。发展基于基因的分类方法是迫切的要求。我们的目标是建立基因分型。 方法:我们使用了四个前列腺癌数据集。癌症基因组图谱(TCGA)RNA-Seq数据用于训练分类器。基于分类器的三个亚型被测试是否具有临床数据存在显着差异
夜神moon
6年前
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大数据挖掘对癌症治疗的四大影响
在瑞士达沃斯召开的世界经济论坛上的一个panel讨论中,美国副总统Joe Biden当场要求临床医生和研究者举例表示人类在抗击癌症中突破的障碍。当几个重要话题浮现时,最重要的议题是“大数据”,具体而言,即“大数据”的收集、分析和应用。 大量的肿瘤DNA测序通
沉默术士
7年前
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Establishment of a SVM classifier to predict recurrence of ovarian cancer
摘要 使用卵巢癌(OC)的基因表达数据用于鉴定感兴趣的基因和 支持向量机(SVM)分类器预测OC的复发。三个数据集 (GSE17260,GSE44104和GSE51088)从Gene Expression下载 。样品中差异表达的基因(DEG)来自非复发性和复
夜神moon
6年前
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