ucsc数据库

阿里云 > 云栖社区> 主题地图> U> ucsc数据库

ucsc数据库 相关的博客

biostar handbook(四)|生物数据及其下载和基本操作

2017/11/9 第一版： 生物数据库，基本数据类型（genbank， fasta/fastq），数据上传站点 2017/11/12 第二版：如何利用esearch, efecth快速获取SRR序列号 生物数据库 目前绝大部分数据由NCBI, EMBL-E
徐洲更 7年前 1571

用Bioconductor对基因组注释

这一次，我们来聊聊基因组注释。首先问自己一个问题，为什么要进行基因注释。 就我目前而言，它用来解决如下问题： 在mapping-by-sequencing的时候，我找到了一些可能的突变位点，我需要知道这些突变分别是那些基因发生突变，这些突变基因有哪些功能？
徐洲更 7年前 963

如何对基因组序列进行注释

基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction)：通过已有的概率模型来预测基因结构，在预测剪切位点和UTR区准确性较低 同源预测(
徐洲更 6年前 4101

Bioconductor的数据类型

Introduction to Bioconductor for Sequence Data 在院士组轮转的时候，由于没人安排我去做什么，我也不懂怎么和别人交流，于是那些日子就在翻译Biocondutor的教程中度过。本文为我学习Bioconductor所写
徐洲更 6年前 842

转录组入门（4）：了解参考基因组及基因注释

转录组入门(4)：了解参考基因组及基因注释 在UCSC下载hg19参考基因组，我博客有详细说明，从gencode数据库下载基因注释文件，并且用IGV去查看你感兴趣的基因的结构，比如TP53,KRAS,EGFR等等。 作业，截图几个基因的IGV可视化结构！还可
徐洲更 7年前 909

阿里云提供高效基因序列检索功能，助力冠状病毒序列快速分析

1.背景介绍 2019年年底，中国的新兴的商业中心武汉，爆发了一种新型的冠状病毒，在流行的两个多月中，在中国造成了3300多人死亡，8万2千多人感染。随着疫情的进一步蔓延，目前已经横跨了109个国家，造成了80多万人感染，4万多人失去了生命。到目前为止，疫情
Roin123 4年前 697

如何使用MACS进行peak calling

MACS2是peak calling最常用的工具。 callpeak用法 这是MACS2的主要功能，因为MACS2的目的就是找peak，其他功能都是可有可无，唯独callpeak不可取代。最简单的用法就是 # 常规的peak calling macs2 ca
徐洲更 6年前 1886

200种最佳机器学习教程汇总【史上最全】

本文包含了迄今为止大家公认的最佳教程内容。它绝不是网上每个ML相关教程的详尽列表，而是经过精挑细选而成的，毕竟网上的东西并不全是好的。我作者汇总的目标是为了补充我即将出版的新书，为它寻找在机器学习和NLP领域中找到的最佳教程。 通过这些最佳教程的汇总，我可以
【方向】 6年前 6377

相关主题

数据 数据库 数据库 数据库数据库系统数据库管理系统 数据库数据清理 数据分片 数据库 数据库管理数据 关系数据库 数据库创建 创建数据库 数据库瓶颈 数据库连接 数据库当机 数据库培训 数据库 培训 培训数据库 新型数据库 数据库建立 云 数据库 数据库地址 数据库分析 网站数据库 数据库系统 国产数据库 安全数据库 海量数据库 大数据库 数据库加密 网络数据库 企业数据库 动态数据库 内存数据库 记录数据库 数据库工具 数据库 修复 数据库登录 数据库类型 数据库同步 数据库营销 数据库语言 数据库中文 ppt 数据库图标 labview vi 服务器 notes 数据库已坏 不能分配空间 window io监控 pagerduty api asp页面查询数据库代码怎么写 绑定句柄 api 注入 virtualbox中安装虚拟机时出错 python web api发布 监控 花屏