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ATAC-Seq 数据分析(上)
背景: 染色质和染色体的结构和功能 每一条染色单体由单个线性DNA分子组成。细胞核中的DNA是经过高度有序的包装,否则就是一团乱麻,不利于DNA复制和表达调控。这种有序的状态才能保证基因组的复制和表达调控能准确和高效进行。 包装分为多个水平,核小体核心颗粒(
徐洲更
7年前
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biostarhandbook|你真的懂mRNA-seq数据分析了嘛?
RNA-seq数据分析 mRNA-seq是目前最常用的高通量测序技术,一般的用法就是看看基因表达谱,寻找差异表达的基因。我和高通量测序数据分析结缘,也是因为RNA-seq。 一开始我对mRNA-seq数据分析一无所知,跑了"tophat+cufflinks"
徐洲更
6年前
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使用RNA-seq数据通过网络熵评估肿瘤内异质性
scientific report第6卷,文章编号:37767(2016) 摘要 肿瘤内异质性(ITH)出现在肿瘤进展、转移和复发的不同阶段,而这些对于临床应用是重要的。我们使用来自肿瘤样品的RNA测序数据,并根据生物网络状态测量ITH水平。为了模拟基因之间
夜神moon
6年前
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大数据基础知识问答----spark篇,大数据生态圈
Spark相关知识点 1.Spark基础知识 1.Spark是什么? UCBerkeley AMPlab所开源的类HadoopMapReduce的通用的并行计算框架 dfsSpark基于mapreduce算法实现的分布式计算,拥有HadoopMapReduc
season雅宁
8年前
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Wireshark抓包工具--TCP数据包seq ack等解读
1、Wireshark的数据包详情窗口,如果是用中括号[]括起来的,表示注释,在数据包中不占字节 2、在二进制窗口中,如“DD 3D”,表示两个字节,一个字节8位 3、TCP数据包中,seq表示这个包的序号,注意,这个序号不是按1递增的,而是按tcp包内数据字
杨粼波
7年前
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学习笔记CB014:TensorFlow seq2seq模型步步进阶
神经网络。《Make Your Own Neural Network》,用非常通俗易懂描述讲解人工神经网络原理用代码实现,试验效果非常好。 循环神经网络和LSTM。Christopher Olah http://colah.github.io/posts/2
利炳根
6年前
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深度学习的seq2seq模型
从rnn结构说起 根据输出和输入序列不同数量rnn可以有多种不同的结构,不同结构自然就有不同的引用场合。如下图, one to one 结构,仅仅只是简单的给一个输入得到一个输出,此处并未体现序列的特征,例如图像分类场景。 one to many 结构,给一
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7年前
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大数据Scala系列之高阶函数
大数据Scala系列之高阶函数 1.1. 概念 如果一个函数的传入参数为函数或者返回值是函数,则该函数即为高阶函数。 1.2. 传入参数为函数 Scala中,函数是头等公民,和数字一样。不仅可以调用,还可以在变量中存放函数,也可以作为参数传入函数,或者作为函
好程序员
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gun_hap
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