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基因功能注释
基因功能的注释依赖于上一步的基因结构预测,根据预测结果从基因组上提取翻译后的 蛋白序列 和主流的数据库进行比对,完成功能注释。常用数据库一共有以几种: Nr:NCBI官方非冗余蛋白数据库,包括PDB, Swiss-Prot, PIR, PRF; 如果要用DN
徐洲更
6年前
1238
如何对基因组序列进行注释
基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de novo prediction):通过已有的概率模型来预测基因结构,在预测剪切位点和UTR区准确性较低 同源预测(
徐洲更
6年前
4101
一个用interproscan做基因注释的简易教程
官网地址: http://www.ebi.ac.uk/interpro/download.html github使用手册地址: https://github.com/ebi-pf-team/interproscan/wiki 1.下载、解压、安装 下载链接:
卖萌哥、
6年前
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