blast数据库的介绍
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blast数据库的介绍 相关的博客
这或许是我写的最全的BLAST教程
Basic local alignment search tool (BLAST) 包括:blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda bl
徐洲更
7年前
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biostar handbook(七)| BLAST
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7年前
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基因功能注释
基因功能的注释依赖于上一步的基因结构预测,根据预测结果从基因组上提取翻译后的 蛋白序列 和主流的数据库进行比对,完成功能注释。常用数据库一共有以几种: Nr:NCBI官方非冗余蛋白数据库,包括PDB, Swiss-Prot, PIR, PRF; 如果要用DN
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应该是最好的eggnog-mapper功能注释教程
eggnog-mapper实现功能注释 eggNOG-Mapper介绍 通常功能注释的思路都是基于序列相似性找直系同源基因,常见的方法就是BLAST+BLAST2GO, 或者是InterProScan。eggNOG-mapper的作者认为这种方法不够可靠,毕
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如何对基因组序列进行注释
基因组组装完成后,或者是完成了草图,就不可避免遇到一个问题,需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型,有三种策略: 从头注释(de novo prediction):通过已有的概率模型来预测基因结构,在预测剪切位点和UTR区准确性较低 同源预测(
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阿里云提供高效基因序列检索功能,助力冠状病毒序列快速分析
1.背景介绍 2019年年底,中国的新兴的商业中心武汉,爆发了一种新型的冠状病毒,在流行的两个多月中,在中国造成了3300多人死亡,8万2千多人感染。随着疫情的进一步蔓延,目前已经横跨了109个国家,造成了80多万人感染,4万多人失去了生命。到目前为止,疫情
Roin123
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解密阿里云高效病原体基因检测工具
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skin778
4年前
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MCScanX使用小记
一篇不知道拖了多久的笔记……欠下的债早晚还是要还的…… 0.软件下载及安装 官网: http://chibba.pgml.uga.edu/mcscan2/ 参考教程: 其实之前已经有两位前辈写过教程了的,我这只是再给需要的朋友举个例子打个样。详情请戳下面两个
卖萌哥、
6年前
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