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基因功能注释

基因功能的注释依赖于上一步的基因结构预测，根据预测结果从基因组上提取翻译后的 蛋白序列 和主流的数据库进行比对，完成功能注释。常用数据库一共有以几种： Nr：NCBI官方非冗余蛋白数据库，包括PDB, Swiss-Prot, PIR, PRF; 如果要用DN
徐洲更 6年前 1238

biostar handbook(七)| BLAST

Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda bl
徐洲更 6年前 1036

这或许是我写的最全的BLAST教程

Basic local alignment search tool (BLAST) 包括：blastn, blastp, blastx, tblastn, tblastx等. 使用conda安装即可。 conda install -c bioconda bl
徐洲更 6年前 1822

如何对基因组序列进行注释

基因组组装完成后，或者是完成了草图，就不可避免遇到一个问题，需要对基因组序列进行注释。注释之前首先得构建基因模型，有三种策略： 从头注释(de novo prediction)：通过已有的概率模型来预测基因结构，在预测剪切位点和UTR区准确性较低 同源预测(
徐洲更 6年前 4101

《利用Python进行数据分析·第2版》第14章 数据分析案例

第1章 准备工作第2章 Python语法基础，IPython和Jupyter第3章 Python的数据结构、函数和文件第4章 NumPy基础：数组和矢量计算第5章 pandas入门第6章 数据加载、存储与文件格式第7章 数据清洗和准备第8章 数据规整：聚合、
seancheney 6年前 1316

利用python做数据分析 札记（二）

实验环境：Anaconda-> Jupyter 参考数据：利用python进行数据分析 python版本 3.5.2 所有的源文件和所需的数据地址是http://download.csdn.net/detail/liangjbdd/8842239#comme
墨持alvin 7年前 869

Python【8】-分析json文件

一、本节用到的基础知识 1.逐行读取文件 for line in open('E:\Demo\python\json.txt'): print line 2.解析json字符串 Python中有一些内置模块可以非常便捷地将json字符串转换为Python对象。
技术小胖子 6年前 1187

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