EHPC分子动力学最佳实践
EHPC分子动力学最佳实践
本文档以一个简单的分子动力学算例,介绍阿里云EHPC分子动力学最佳实践。
EHPC分子动力学 最佳实践 部署架构图 场景描述 本实践适用于使用弹性高性能计算 EHPC+文件存储 NAS+ECS弹性供应在阿里云上低 成本构建分子模拟 MDaaS(Molecular Dynamics as a Service)超算集群。解决问题 1.使用 EHPC运行分子动力学软件 CP2K 2.使用文件存储 NAS存储数据和代码 3.使用 ECS弹性伸缩组构建集群弹性 产品...
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基于HBR云上统一备份
基于HBR云上统一备份
场景描述 混合云备份(简称HBR)是一种简单易用且高性价 比的在线备份服务,可以为阿里云ECS,NAS,OSS 以及自建机房内的各类数据提供安全,高效的保护。 本文介绍如何通过HBR对云上数据进行统一备份管 理。 解决问题 1.备份阿里云云上数据。 2.备份数据中心数据。 适用云资源 ECS文件系统 NAS文件 OSS文件 ECS上自建的MySQL、Oracle、SQLServer数据库 ESC上自建的SAPHANA数据库 产品列表 1.HBR备份服务 2.云服务器ECS 3.文件系统NAS 4.对象存储OSS 云上统一备份 云下统一备份 上云备份 备份上云
产品列表 适用云资源 混合云备份 HBR ECS文件系统 云服务器 ECS NAS文件 文件系统 NAS OSS文件 对象存储 OSS ECS上自建的 SQL Server数据库 ECS上自建的 My SQL 数据库 ECS上自建的 Oracle 数据库 ECS上自建的 SAP HANA数据库 阿里云最佳实践技术分享群 最佳实践频道 云服务器 ECS(产品名称)文档模板(手册名称)/文档...
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数据迁移上云
数据迁移上云
随着越来越多的企业选择将业务系统上云,各种类型的数据如何便捷、平滑的迁移上 云,成了用户上云较为关注的点;业务上云后,因为业务或者其他方面调整等因素, 也存在如跨区域,跨账号等数据迁移的场景。针对以上需求,阿里云上提供了较为丰 富的工具(如ossimport)、服务(在线迁移服务),旨在能够帮助客户便捷进行数据迁 移。 本文通过云架构设计工具CADT来快速创建云上基础资源,并以杭州区域来模拟线 下IDC(或友商),深圳区域模拟阿里云云上资源。通过云上的工具命令、服务来提 供常见数据迁移场景的最佳实践。
(2)在线迁移前会检查源地址和目的地址的文件,但是若您源和目的有相同文件名的 文件,且源地址的文件更新时间比目的地址文件更新时间晚,迁移时会直接覆盖目的 地址的文件。若两个文件内容不同,必须更改文件名或做好备份。1.如果系统提示该功能在公测中,请单击去申请提交白名单权限申请。2.填写相关信息,提交迁移公测...
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基于弹性计算的AI推理
基于弹性计算的AI推理
场景描述 本方案适用于使用GPU进行AI在线推理的场 景。在推理之前,模型已经训练完成。例如,刷脸 支付中,我们在刷脸的时候,就是推理的一个过 程。再比如图像分类,目标检测,语音识别,语 义分析等返回结果的过程。 解决问题 使用GPU云服务器搭建推理环境 使用容器服务Kubernetes版构建推理 环境 使用NAS存储模型数据 使用飞天AI加速推理工具加速推理 产品列表 GPU云服务器 容器服务Kubernetes版 NAS共享存储
cd perseus-inference/ls cp-r resnet50_*/mnt/cd/mnt rm-rf/mnt/lost+found/ls 45 企业上云实践 基于弹性计算的 AI推理|部署飞天 AI加速推理工具的 demo 注意:这里镜像启动时,会在/mnt目录下找第一个文件夹下的model.config ,如果找不到容器无法启动。4.4.使用 arena 部署 model server 4.4.1.安装最新版本的 arena...
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企业用户多账号合并之存储迁移集中
企业用户多账号合并之存储迁移集中
场景描述 本文介绍使用在线迁移服务,将分布在各个云 账号中的对象存储、文件存储数据集中到一个 账号的对象存储或文件存储下。 解决问题 1.安全治理需求,统一的账户体系、身份、权 限及资源管理。 2.业务系统相互访问,数据统一需求。 3.系统架构及资源成本优化需求,多账号下的 带宽、流量、存储包等资源整合优化。 4.企业或部门合并时云账号的合并。 产品列表 RAM OSS NAS 在线迁移
因 在线迁移服务会比对源数据地址和目的数据地址中的文件,若目的数据地址中有 与源数据地址同名的文件,且源数据地址中该文件的更新时间比目的数据地址中 该文件的更新时间晚,则迁移服务会用源文件地址中的文件覆盖目的数据地址中 的文件。全量数据迁移任务多次提交时,如果文件名一致、ContentType 一致、大小相同 且...
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EHPC药物筛选
EHPC药物筛选
场景描述 本方案适用于使用弹性高性能计算 EHPC和文件存储NAS来搭建基础环 境,运行药物筛选应用AutodockVina 的场景中,这里采用批处理方式来提交 作业,并可以可视化计算结果。 方案架构 1.计算之前,将数据通过互联网/闪电立方/高速通道上传到阿里云OSS 2.计算时,将数据从OSS拉取到文件共享存储NAS上 3.计算时,在EHPC集群上进行,计算节点从NAS上读写数据 • 容量型NAS:低成本,大容量 • 性能型NAS:适合高IOPS应用,作为临时目录 • CPFS:适合超大规模,并行度极高的作业 4.计算节点: • 如果对计算时间不敏感,希望低成本运算,可选ECS实例 • 如果时效性要求高,建议采用SCC超级计算集群 5.可视化 • 如果可视化部分计算量不大,可以采用EHPC自带的可视化服务 解决问题 1.使用EHPC运行药物筛选应用 2.使用nas存储计算数据 3.使用OSS保存计算结果 • 通过分子对接(moleculardocking)模拟计算进行药物筛选,是模拟小分子配体和生物大分子受体的 相互作用,预测配体和受体的结合模式和亲和力。 • 通常,有很多已有的配体库,如商业化的Specs、Enamine和ChemDiv化合物库。提供大量配体,模 拟计算就是计算这些配体和给定受体的相互作用。 • 每次模拟计算通常处理一个配体和一个受体,不同配体之间没有依赖,因此可以同时大规模并行处 理。 本解决方案同样适用于有批量、高并发处理需求的其它生物、医药等场景。 产品列表 弹性高性能计算E-HPC 文件存储NAS 对象存储OSS
1fkn_rgd.pdbqt 是受体的文件,配体 在 test 目录下,有 30 个:这里会计算1fkn与每一个配体的亲和度,这个例子只用来demo,并不具有实际意义。vina-ehpcarrayjob.tar.gz 这个文件可以从本方案提供的代码里获取。[root@login0~]#tar xzvf vina-ehpcarrayjob.tar.gz[root@login0~]#cd vina-ehpcarrayjob[root@login0 ...
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利用低成本链路完成业务数据迁移上云
利用低成本链路完成业务数据迁移上云
场景描述 随着云计算被越来越多的客户所接受,除业务系 统上云外,很多客户已经把业务数据搬迁上云。 业务数据量一般都比较大,迁移上云需要大量的 网络带宽,BGP费用比较高。阿里云对用户开 放所需地域购买静态单线共享带宽包的权限(移 动/联通/电信均可),可用为迁移数据有效降低 成本。 解决问题 1.业务数据上云网络成本高 产品列表 专有网络VPC 云服务器ECS 网络存储NAS 共享带宽包
df-h 18 文档版本:20191230 利用低成本链路完成业务数据迁移上云 数据迁移 步骤4 将A主机目录/qianyi下的所以文件(包括目录)复制到本B目录/mnt下。scp-rroot@47.xxx.xxx.114:/qianyi/mnt 每秒13MB左右速率=100mbps左右带宽,总耗时3分多钟。步骤5 进入NAS文件夹查看传输过来的文件。cd/mnt/qianyi ll 比较下之前的文件...
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超级计算集群实现自然语言处理训练
超级计算集群实现自然语言处理训练
场景描述 本方案适用于自然语言训练场景,使用神龙 GPU云服务器(SCCGN6)+CPFS进行NLP的 训练,采用Bert模型。这里不使用容器,直接 使用裸机进行NLP的Bert训练,使用飞天AI加 速训练工具可以有效提升多机多卡的训练效率。 解决问题 使用神龙GPU云服务器搭建NLP训练环 境 使用SCC的RDMA网络 使用CPFS存储训练数据 使用飞天AI加速训练工具加速训练 产品列表 神龙GPU云服务器(SCCGN6) SCC超级计算集群 CPFS共享存储
 在左侧导航栏,单击文件系统>文件系统列表  在文件系统列表页面,单击目标文件系统名称,进入文件系统详情页,单击挂载使用。 在客户端管理节点区域,列表中第一个ECS实例默认为CPFS客户端安装节点,远程连接 该ECS实例。17企业上云实践 基于超级计算集群的自然语言处理AI训练 18企业上云实践 基于超级计算集群的...
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KVM on弹性裸金属
KVM on弹性裸金属
场景描述 神龙是一款兼具虚拟机弹性和物理机性能及特性的 新型计算产品,为用户上云提供便捷。上一篇《阿里 云弹性裸金属最佳实践之VMwareon神龙》介绍了 基于阿里云神龙部署VMware,本篇指导用户基于神 龙自行创建KVM虚拟机。用户在将线下基于KVM 的业务灵活部署上云的同时,可充分管理和利用云上 计算资源。 解决问题 1.为传统企业提供在阿里云上自建KVM虚拟化平 台的解决方案。 2.基于KVM虚拟化平台的系统如何迁移上云。 产品列表 1.弹性裸金属服务器 2.文件系统NAS 3.弹性公网IP
启动KVM虚拟机VM1  file填写qcow2的镜像文件路径  id=eth_vm1和/dev/tap11填写ipvtap设备名称  mac填写vm1使用的ENI的mac地址 -vnc0.0.0.0:port1就是5901,2就是5902,依次类/root/qemu-2.3.0-rc4/x86_64-softmmu/qemu-system-x86_64-machine pc-i440fx-2.1,accel=kvm,kernel_irqchip=off-cpu host-smp 2-m 8192-...
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云端影视渲染
云端影视渲染
场景描述 本文介绍如何搭建一个完整的混合云渲染服务架构,本地与云端的网络以SSL-VPN方式进行互联。 解决问题 1、使用SSL-VPN构建本地网络与云上VPC环境的安全互联。 2、使用批量计算服务管理渲染计算集群,集群计算节点自动加入Deadline资源池。 3、使用Deadline做渲染任务管理。 4、批量计算集群计算节点根据Deadline渲染任务自动扩容和收缩,资源管理自动化。 产品列表 1、云服务器ECS 2、GPU云服务器GPU 3、批量计算BCS 4、专有网络VPC 5、弹性公网IP 6、文件存储NAS
如果系统提示配置文件的格式问题,请使用写字板程序将配置文件 config.ini另存为一 份纯文本文件格式的文件,并使用该新的配置文件启动自动伸缩插件。步骤6 此时可以看到 deadline web services的运行窗口内日志滚动。文档版本:20200220 114 云端影视渲染 自动伸缩脚本部署及验证 步骤7 查看日志文件,确认自动伸缩脚本...
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RAPIDS加速机器学习
RAPIDS加速机器学习
场景描述 本方案适用于使用RAPIDS加速库+GPU 云服务器来对机器学习任务或者数据科学 任务进行加速的场景。相比CPU,利用 GPU+RAPIDS在某些场景下可以取得非常 明显的加速效果。 解决问题 1.搭建RAPIDS加速机器学习环境 2.使用容器服务Kubernetes版部署 RAPIDS环境 3.使用NAS存储计算数据 产品列表 容器服务Kubernetes版 GPU云服务器 文件存储NAS
使用 NAS存储计算数据 最佳实践频道 阿里云最佳实践分享群 产品列表 容器服务 Kubernetes版 GPU云服务器 文件存储 NAS 如二维码过期,请搜索群号:31852400 云服务器 ECS(产品名称)文档模板(手册名称)/文档版本信息 阿里云智能 RAPIDS加速机器学习 最佳实践 文档版本:20200114 文档版本:20150122(发布日期)II ...
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EHPC混合云渲染
EHPC混合云渲染
介绍在混合云环境下,利用E-HPC及其文件缓存机制,无缝读取线下存储中的项目资产,免去复杂繁琐的文件同步问题;充分利用云上资源弹性、按使用付费的优势,构建高性能、高可靠和可扩展的渲染服务。 解决问题 l混合云环境下本地集群与云端集群一体化的渲染服务。 l避免繁琐复杂的本地与云端的文件同步问题。 l低成本、高效率应对渲染业务峰值。 产品列表 l云服务器、GPU云服务器 l高性能计算E-HPC l专有网络VPC l云企业网CEN l弹性公网IP EIP l访问控制RAM l文件存储NAS
E-HPC混合云渲染最佳实践 场景描述 部署架构图:介绍在混合云环境下,利用 E-HPC及其文件缓存 机制,无缝读取线下存储中的项目资产,免去复 杂繁琐的文件同步问题,充分利用云上资源弹 性、按使用付费的优势,构建高性能、高可靠和 可扩展的渲染服务。解决问题 混合云环境下本地集群与云端集群一体化的渲染 服务。避免繁琐...
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混合云使用Ali-Perseus
混合云使用Ali-Perseus
场景描述 本文介绍了混合云场景中,自建 Kubernetes服务,线下集群+云上弹性扩 展阿里云GPU服务实例+飞天AI加速工 具,并采用阿里云CPFS存储,运行AI训 练+AI推理作业的操作步骤。 解决问题 1.利用云企业网打通两个地域的VPC, 自建Kubernetes集群 2.使用飞天AI加速工具运行训练和推理 作业 3.使用CPFS存储共享数据 产品列表 云企业网CEN GPU云服务器 并行文件存储CPFS 文件存储NAS
运行推理任务.62 V 混合云使用飞天AI加速工具 最佳实践概述 最佳实践概述 AI数据处理流程 AI数据处理一般分为三个步骤,数据采集,清洗标注,模型训练,模型部署与 理。方案场景描述 在混合云场景中,可以自建 Kubernetes服务,线下集群+云上弹性扩展阿里云 GPU 服务实例+飞天 AI加速工具加速框架,并采用阿里云 CPFS存储...
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RAPIDS加速图像搜索
RAPIDS加速图像搜索
场景描述 本方案适用于使用RAPIDS加速平台 +GPU云服务器来对图像搜索任务进行加 速的场景。相比CPU,利用GPU+ RAPIDS在图像搜索场景下可以取得非常 明显的加速效果。 解决问题 1.搭建RAPIDS加速图像搜索环境 2.使用容器服务Kubernetes版部署图 像搜索环境 3.使用NAS存储计算数据 产品列表 容器服务Kubernetes版 GPU云服务器 文件存储NAS
使用 NAS存储计算数据 产品列表 容器服务 Kubernetes版 GPU云服务器 文件存储 NAS 最佳实践频道 阿里云最佳实践分享群 如二维码 过期,请搜索群 号:31852400 云服务器 ECS(产品名称)文档模板(手册名称)/文档版本信息 阿里云智能 RAPIDS加速图像搜索 最佳实践 文档版本:20200114 文档版本:20150122(发布日期)II ...
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混合云HBR云上备份VMware虚拟机
混合云HBR云上备份VMware虚拟机
场景描述 本文主要介绍一种简单且具备成本效益的混合云下 的备份解决方案,可以为任何位置的客户虚拟机和数 据提供强有力的保护,包括企业数据中心、远程和分 支机构以及云上资源;支持加密、压缩、重删,保证 数据快速、安全、高效地备份到云上,本文重点介绍 混合云下的VMware虚拟机备份。 解决问题 1.混合云下的备份解决方案。 2.VMware虚拟机备份解决方案。 产品列表 1.弹性裸金属服务器 2.文件系统NAS 3.弹性公网IP 4.NAT网关
 HBR可支持文件、虚拟机、工作流和SQLServer等备份,本例以VMware虚拟 备份为例。文档版本:20190716 2 混合云HBR云上备份VMware虚拟机 演示环境说明 演示环境说明  本文中需要开通资源的地方,如未有特别说明,开通地域统一使用阿里云华东2(上海),本文使用如下资源:产品或服务 本文示例 弹性网卡ENI 地域:华东2...
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