EHPC药物筛选
EHPC药物筛选
场景描述 本方案适用于使用弹性高性能计算 EHPC和文件存储NAS来搭建基础环 境,运行药物筛选应用AutodockVina 的场景中,这里采用批处理方式来提交 作业,并可以可视化计算结果。 方案架构 1.计算之前,将数据通过互联网/闪电立方/高速通道上传到阿里云OSS 2.计算时,将数据从OSS拉取到文件共享存储NAS上 3.计算时,在EHPC集群上进行,计算节点从NAS上读写数据 • 容量型NAS:低成本,大容量 • 性能型NAS:适合高IOPS应用,作为临时目录 • CPFS:适合超大规模,并行度极高的作业 4.计算节点: • 如果对计算时间不敏感,希望低成本运算,可选ECS实例 • 如果时效性要求高,建议采用SCC超级计算集群 5.可视化 • 如果可视化部分计算量不大,可以采用EHPC自带的可视化服务 解决问题 1.使用EHPC运行药物筛选应用 2.使用nas存储计算数据 3.使用OSS保存计算结果 • 通过分子对接(moleculardocking)模拟计算进行药物筛选,是模拟小分子配体和生物大分子受体的 相互作用,预测配体和受体的结合模式和亲和力。 • 通常,有很多已有的配体库,如商业化的Specs、Enamine和ChemDiv化合物库。提供大量配体,模 拟计算就是计算这些配体和给定受体的相互作用。 • 每次模拟计算通常处理一个配体和一个受体,不同配体之间没有依赖,因此可以同时大规模并行处 理。 本解决方案同样适用于有批量、高并发处理需求的其它生物、医药等场景。 产品列表 弹性高性能计算E-HPC 文件存储NAS 对象存储OSS
详见 https://www.aliyun.com/product/oss 云速搭 CADT:是一款为上云应用提供自助式云架构管理的产品,显著地降低 云上管理的难度和时间成本。本产品提供丰富的预制应用架构模板,同时也支持自 助拖拽方式定义应用云上架构;支持较多阿里云服务的配置和管理。用户可以方便的 对云上架构方案的成本、部署、运维、回收...
来自: 最佳实践 相关产品:云服务器ECS,对象存储 OSS,文件存储NAS,弹性高性能计算E-HPC
大数据workshop
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详见:https://www.aliyun.com/product/ecs DataHub:数据总线(DataHub)服务是阿里云提供的流式数据(Streaming Data)服务,它提供流式数据的发布(Publish)和订阅(Subscribe)的功能,让您可以轻 松 构 建 基 于 流 式 数 据 的 分 析 和 。详见:https://www.aliyun.com/product/datahub 实时计算 Flink 版:实时计算 ...
来自: 最佳实践 | 相关产品:块存储,云服务器ECS,云数据库RDS MySQL 版,对象存储 OSS,弹性公网IP,数据传输,DataWorks,大数据计算服务 MaxCompute,DataV数据可视化,实时计算,数据总线,Quick BI,Hologres
在线教育流量洪峰
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1. 通过Tair缓存的性能增强型解决高并发读的性能问题,通过持久内存型解决大并发写性能及数据可靠性问题。 2. PolarDB作为主数据库保存业务的交易数据,通过弹性能力和并发SQL解决性能瓶颈。 3. ADB+QuickBI提供的数据仓库方案通过分时弹性能力和实时业务展现能力。
经过阿里巴巴双十一活 动的最佳实践,让用户既享受到开源的灵活性与价格,又享受到商业数据库的 高性能和安全性。更多信息,请参见 https://www.aliyun.com/product/polardb ADB:云原生数据仓库 AnalyticDB MySQL 版(简称 ADB,原分析型数据库 MySQL版)是一种支持高并发低延时查询的新一代云原生数据仓库,全面兼容 ...
来自: 最佳实践 | 相关产品:云数据库 Redis 版,云数据库PolarDB,云原生数据仓库AnalyticDB My,Quick BI
金融专属大数据workshop
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实践目标 学习搭建一个实时数据仓库,掌握数据采集、存储、计算、输出、展示等整个业务流程。 整个实时数据仓库系统全部基于阿里云产品进行架构搭建,用户可以掌握并学会运用各个服务组件及各个组件之间如何联动。 理解阿里云原生实时离线一体数仓解决方案架构以及掌握交付落地的实践使用方法。 前置知识要求 熟练掌握SQL语法 对大数据体系系统知识有一定的了解
见:https://www.aliyun.com/product/bigdata/hologram  云数据库RDSMySQL版:云数据库RDSMySQL版是全球最受欢迎的开源数据 文档版本:20210803(发布日期)III阿里云最佳实践大数据WorkShop 产品介绍 库之一,作为开源软件组合LAMP(Linux+Apache+MySQL+Perl/PHP/Python)中 的 重 要 一 环,广 泛 于 各 类 ...
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云原生大数据计算服务MaxCompute
阿里云云原生大数据计算服务MaxCompute是面向分析的企业级云数仓,作为一体化大数据智能计算平台ODPS的大规模批量计算引擎,MaxCompute以 Serverless 架构提供快速、全托管的在线数据仓库服务,使您经济高效的分析处理海量数据,进行敏捷的业务洞察。
支持与AirFlow、Tableau等开源和商业产品灵活组合,构建丰富的数据应用.89A_优势 板式一-new.89A_精心打造的功能标题-new.孙慧颖,靖鑫,也树.全托管的 Serverless 在线服务.对外以API方式访问的在线服务,开箱即;预铺设的大规模集群资源,按需使用和付费;无需平台运维,最小化运维投入.存储和计算独立扩展,支持企业将...
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云原生数据库
PolarDB是阿里云自研的云原生数据库,在存储计算分离架构下,利用了软硬件结合的优势,为用户提供秒级弹性、高性能、海量存储、安全可靠的数据库服务。100%兼容MySQL和PostgreSQL生态,支持分布式扩展,高度兼容Oracle语法。
数据库和应用迁移ADAM数据库评估、在线数据库改造及应用评估等云上功能全部免费,提供包括数据库与应用评估(兼容性、关联关系、性能、风险点、应用改造点)、转换建议(转换不兼容点、引擎特征优化转换)和应用评估等.数据库专家服务.以工具与数据库专业技能结合的方式,助力客户快速低成本实现Oracle功能,覆盖迁移的全...
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自建Hive数据仓库跨版本迁移到阿里云Databricks数据洞察
自建Hive数据仓库跨版本迁移到阿里云Databricks数据洞察
场景描述 客户在IDC或者公有云环境自建Hadoop集群构建数据仓库和分析系统,购买阿里云Databricks数据洞察集群之后,涉及到数仓数据和元数据的迁移以及Hive版本的订正更新。 方案优势 1. 全托管Spark集群免运维,节省人力成本。 2. Databricks数据洞察与阿里云其他产品(OSS、RDS、MaxCompute、EMR)进行深度整合,支持以这些产品为数据源的输入和输出。 3. 使用Databricks Runtime商业版引擎相比开源Spark性能有3-5倍的提升。 解决问题 1. Hive数仓数据迁移OSS方案。 2. Hive元数据库迁移阿里云RDS方案。 3. Hive跨版本迁移到Databricks数据洞察使用Delta表查询以提高查询效率。
步骤8 将修改好配置文件的 Hadoop软件目录通过 scp命令远程拷贝到 slave1、slave2和 slave3节点。scp-r/usr/local/hadoop-2.10.1 root@slave1:/usr/local/scp-r/usr/local/hadoop-2.10.1 root@slave2:/usr/local/scp-r/usr/local/hadoop-2.10.1 root@slave3:/usr/local/步骤9 格式化 master节点的 namenode。hdfs namenode-...
来自: 最佳实践 | 相关产品:专有网络 VPC,云服务器ECS,对象存储 OSS,文件存储HDFS,spark
数据集成 Data Integration
阿里云数据集成 Data Integration是跨异构数据、低成本、弹性扩展的数据采集同步平台,为DataX的商业版,支持ETL,支持50+数据源跨网络离线(全量/增量)同步。
数据集成 Data Integration.数据集成 Data Integration是阿里集团对外提供的可跨异构数据...云数据库RDS MySQL版.MySQL 是全球最受欢迎的开源数据库之一,作为开源软件组合 LAMP中的重要一环,广泛应用于各类应用场景.52A_更多产品与服务.52A_【标题】更多产品与服务.谢赟辉,靖鑫,纾沉,冷莉营.谢赟辉,靖鑫,也树,纾沉,冷莉营.
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智能商业分析 Quick BI
瓴羊智能商业分析 Quick BI 是阿里云用户臻选的数据可视化工具,大幅提升数据分析和报表开发效率,一站式满足企业各种场景的数据分析和决策的诉求。
产品解决方案文档与社区权益中心定价云市场合作伙伴支持与服务了解阿里云AI 助理备案控制台智能商业分析 Quick BI产品简介产品优势产品功能产品选型入门与试用技术解决方案产品定价安全合规客户案例常见问题社区智能商业分析 Quick BIQuick BI 提供智能化数据分析及可视化能力,满足用户数据准备、数据分析、数据可视化等...
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