EHPC分子动力学最佳实践
EHPC分子动力学最佳实践
本文档以一个简单的分子动力学算例,介绍阿里云EHPC分子动力学最佳实践。
阿里账号下已开通以下阿里服务:ᅳ EHPC服务 ᅳ 文件存储 NAS服务 ᅳ 对象存储 OSS服务器 ECS ᅳ 云速搭 CADT 下载本文用到的操作命令和代码:以 CentOS主机为例:#yum-y install git#git clone https://code.aliyun.com/best-practice/230.git 其中,samplecode.sh包含了所有使用的命令。如果你是 windows主机,...
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EHPC工业仿真
EHPC工业仿真
场景描述 本实践适用于使用弹性高性能计算EHPC+ 对象存储OSS运行仿真软件进行模型仿真 的场景中,这里运行的是LAMMPS这款开 源的仿真软件,数据通过OSS上传。 解决问题 1.使用EHPC运行工业仿真软件 2.使用OSS存储数据和代码 3.可视化计算结果 产品列表 弹性高性能计算E-HPC 对象存储OSS
可视化计算结果 产品列表 弹性高性能计算 E-HPC 对象存储 OSS 文件存储 NAS 云速搭 CADT 最佳实践频道 阿里最佳实践技术分享群 如二维码过期,请搜索群号:31852400 服务器 ECS(产品名称)文档模板(手册名称)/文档版本信息 阿里 EHPC工业仿真 最佳实践 发布日期:20210813 文档版本:20150122(发布日期)II EHPC...
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EHPC药物筛选
EHPC药物筛选
场景描述 本方案适用于使用弹性高性能计算 EHPC和文件存储NAS来搭建基础环 境,运行药物筛选应用AutodockVina 的场景中,这里采用批处理方式来提交 作业,并可以可视化计算结果。 方案架构 1.计算之前,将数据通过互联网/闪电立方/高速通道上传到阿里云OSS 2.计算时,将数据从OSS拉取到文件共享存储NAS上 3.计算时,在EHPC集群上进行,计算节点从NAS上读写数据 • 容量型NAS:低成本,大容量 • 性能型NAS:适合高IOPS应用,作为临时目录 • CPFS:适合超大规模,并行度极高的作业 4.计算节点: • 如果对计算时间不敏感,希望低成本运算,可选ECS实例 • 如果时效性要求高,建议采用SCC超级计算集群 5.可视化 • 如果可视化部分计算量不大,可以采用EHPC自带的可视化服务 解决问题 1.使用EHPC运行药物筛选应用 2.使用nas存储计算数据 3.使用OSS保存计算结果 • 通过分子对接(moleculardocking)模拟计算进行药物筛选,是模拟小分子配体和生物大分子受体的 相互作用,预测配体和受体的结合模式和亲和力。 • 通常,有很多已有的配体库,如商业化的Specs、Enamine和ChemDiv化合物库。提供大量配体,模 拟计算就是计算这些配体和给定受体的相互作用。 • 每次模拟计算通常处理一个配体和一个受体,不同配体之间没有依赖,因此可以同时大规模并行处 理。 本解决方案同样适用于有批量、高并发处理需求的其它生物、医药等场景。 产品列表 弹性高性能计算E-HPC 文件存储NAS 对象存储OSS
使用 OSS保存计算结果 产品列表 弹性高性能计算 E-HPC 文件存储 NAS 对象存储 OSS 云速搭 CADT 最佳实践频道 阿里最佳实践技术分享群 如二维码过期,请搜索群号:31852400 服务器 ECS(产品名称)文档模板(手册名称)/文档版本信息 阿里 企业上云实践 EHPC药物筛选最佳实践 文档版本:20210811 II 企业上云实践 EHPC...
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E-HPC低成本实现量化策略回测
E-HPC低成本实现量化策略回测
在量化交易场景下,量化策略的构建流程一般包括:想法、数据获取、建模、回测、结果分析等,在回测过程中往往需要海量的算力,进行大量数据的分析和处理,如何快速、高效和低成本的进行批量任务的调度,并快速获取结果是量化领域遇到的普遍挑战,这也是云计算能够带给客户的巨大优势。
详见:https://www.aliyun.com/product/eip 文件存储 NAS:是一个可大规模共享访问,弹性扩展的高性能云原生分布式文件 系统。支持智能冷热数据分层,有效降低数据存储成本。广泛应用于企业级应用数 据共享、容器、AI机器学习、Web 服务和内容管理、应用程序开发和测试、媒体 和娱乐工作流、数据库备份等场景。详见:...
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原生数据库 PolarDB
阿里云云原生数据库 PolarDB是一款超级MySQL和PostgreSQL分布式云原生数据库,100%兼容MySQL和PostgreSQL,高度兼容Oracle,无论是集中式部署还是分布式架构,都能轻松融入现有系统,助力企业轻松数据迁移上云。
查看安全合规文档客户案例PolarDB具有容量大、高价比、分钟级弹性、读一致等优点,在互联网金融、汽车、物流、SaaS等行业沉淀了丰富的实践案例,为广大客户解决了诸多业务挑战01富友支付高并发交易和海量数据给富友的数据库带来性能瓶颈、扩展差、运维复杂等挑战,通过原生架构升级+引入原生数据库PolarDB,富友...
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数据库ClickHouse
云数据库ClickHouse 是阿里云提供的分布式实时分析型列式数据库服务。具有高性能、开箱即用、企业特性支持。广泛应用于流量分析、广告营销分析、行为分析、人群划分、客户画像、敏捷BI、数据集市、网络监控、分布式服务和链路监控等业务场景。
ClickHouse 支持时序数据存储、支持原生 decimal、内置包含时间窗口函数在内的150+内置函数,为时序数据的聚合分析提供强力支持 推荐搭配使用 数据库 Redis 版 对象存储 OSS客户案例某潮品社区电商 帮助客户实现实时人群圈选和精准营销。解决自建开源 Elasticsearch 海量日志写入OOM 频发,随机聚合分析效率低问题。数据...
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原生数据仓库AnalyticDB PostgreSQL版
阿里云MPP架构的云原生数据仓库,可提供PB级海量数据在线/离线分析服务,是面向各行各业的有竞争力的数仓方案,真正做到“人人可用的数据分析服务”。
支持多种数据源接入,实时flink,OLTP数据同步,离线支持OSS存储、JSON数据、HyperLogLog等功能特性,数据写入实时可用,复杂查询高性能返回,整体辅助用户实现从数据存储、分析到展现的一体化的实时数据分析平台.基于列存储支持海量数据复杂分析聚合,高并发在线数据探索:基于行存储支持高并发的任意维度在线数据探索....
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原生数据库
PolarDB是阿里云自研的云原生数据库,在存储计算分离架构下,利用了软硬件结合的优势,为用户提供秒级弹性、高性能、海量存储、安全可靠的数据库服务。100%兼容MySQL和PostgreSQL生态,支持分布式扩展,高度兼容Oracle语法。
为用户提供快速弹性、高性能、海量存储、安全可靠的数据库服务,同时支持阿里云自研Ganos多维多模时空信息引擎及开源PostGIS地理信息引擎.PolarDB PostgreSQL 版.PolarDB 分布式版(PolarDB for Xscale,简称“PolarDB-X”)是阿里云自主设计研发的高性能云原生分布式数据库产品,为用户提供高吞吐、大存储、低延时、易扩展和...
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边缘节点服务ENS
阿里云边缘节点服务(Edge Node Service, 简称ENS)基于运营商边缘节点和网络构建,一站式提供“融合、开放、联动、弹性”的分布式算力资源,帮助用户业务下沉至运营商侧边缘,有效降低计算时延和成本。
相比传统方式,边缘节点服务一站式提供海量边缘算力,基于阿里飞天系统的稳定、便利、精准调度能力,帮助用户快速搭建新一代CDN.一站式采购全球边缘节点,减少重复沟通与对接.可视化监控,批量运维操作,阿里飞天沉淀的稳定和迁移能力.精准的流量调度平台,帮助客户实现调度优化.模拟终端用户的精准监测.互联网...
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边缘安全加速 ESA 技术解决方案
ESA边缘安全加速基于全球3200+节点,提供边缘加速、边缘安全、边缘计算的产品能力,费用构成简单易懂,提供丰富的监控报表、日志工具,为客户网站提供一流性能体验。
相关产品服务器ECS对象存储 OSS在线咨询方案优势一键接入方便快捷ESA支持根域名接入加速和防护,提供DNS的托管能力,接入后可设置站点全局配置,也可以自定义子域名配置,提升域名接入和管理的使用效率。自定义加速条件ESA提供各类加速规则,例如回源规则、缓存规则、压缩规则等,可根据自身业务特点,实现按区域回源、...
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OpenLake大数据&AI一体化解决方案
本方案是基于开放可控数据湖仓构建的大数据/搜索/AI一体化解决方案。通过元数据管理平台DLF管理结构化和半/非结构化数据,提供湖仓数据表和文件的安全访问及IO加速。支持多引擎对接和平权协同计算,通过DataWorks统一开发,并保障大规模任务调度。
总体架构包括:1、统一元服务和存储(Meta Service):数据湖构建(Data Lake Formation)提供了全托管的统一元数据服务,包括元数据管理、权限管理和引擎对接等能力,支持全托管/半托管OSS存储、Paimon等多种湖表格式,以及图片/视频和AI模型等文件的统一存储。2、平权的多计算引擎(Multi-Engine):跨数据、搜索和AI...
大模型服务平台百炼
阿里云百炼是企业级大模型开发平台,助力企业轻松打造最优落地效果的AI应用,深度聚焦于人工智能与机器学习的前沿技术,它不仅提供了丰富的多模态模型调用服务,还简化了在线模型训练与部署流程,让开发者能够轻松驾驭大模型,加速创新应用的开发,推动AI技术在各行业的广泛应用。
2024-09-14阿里百炼加入“工开物”高校计划产品体验馆产品优势 高性能易调用,高开放易集成,高可用易落地,超低价安全可信,助力企业打造最优落地效果的大模型应用丰富多样的模型服务,业务落地选择更多大模型能力即开即用,提供优质开源和闭源,文本、语音、图片等多种模态大模型供选择,支持高性能的模型调用服务,...
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日志安全审计与合规评估
日志安全审计与合规性评估方案旨在通过集中化采集、存储、分析来自多个系统、应用和设备的日志数据,确保企业数据和系统安全性与合规性。企业合规团队可基于日志审计来输出合规信息,帮助企业优化安全态势,确保业务连续性和数据安全。
如果调整了资源规格,请以控制台显示的实际报价以及最终账单为准)日志服务 数据库 RDS 文件存储NAS 负载均衡 立即部署 应用场景 技术方案的广泛应用场景 审计日志自动化采集与存储 部分企业客户需要自动化采集存储日志,满足《网络安全等保2.0标准》中的最低要求。多账号审计日志统一管理 跨国企业、大企业以及部分中型...
网站静态资源访问加速
本方案使用阿里云CDN产品来分发OSS上的网站静态文件,不仅可以降低源站的负载压力,还能够提升网站的访问性能,同时还能在高并发场景下为您节约成本。
本方案使用阿里CDN产品来分发OSS上的网站静态文件,不仅可以降低源站的负载压力,还能够提升网站的访问性能,同时还在高并发场景下为您节约成本。网站静态资源访问加速 本方案使用阿里CDN产品来分发OSS上的网站静态文件,不仅可以降低源站的负载压力,还能够提升网站的访问性能,同时还在高并发场景下为您节约成本...
基于OSS Object FC实现非结构化文件实时处理最佳实践
基于<em>OSS</em> Object FC实现非结构化<em>文件</em>实时处理最佳实践
现在绝大多数客户都有很多非结构化的数据存在OSS中,以图片,视频,音频居多。举一个图片处理的场景,现在各种终端种类繁多,不同的终端对图片的格式、分辨率要求也不同,所以一张图片往往会有很多张衍生图,那如果所有的衍生图都存在OSS中,那存储的成本会增加,所以就可以通过OSS Object FC的方案,在不同的终端请求时,对OSS中的原图基于终端的要求做实时处理,然后响应返回,这样OSS中只需要存储原图即可。音视频也有类似的场景。
 阿里云对象存储OSS(ObjectStorageService):是一款海量、安全、低成本、高可靠的 存储服务,可提供99.9999999999%(12个9)的数据持久,99.995%的数据可用。多种 存储类型供选择,全面优化存储成本。 云速搭CADT(CloudArchitectDesignTools):是一款为上云应用提供自助式架构管理 的产品,显著地降低应用...
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精准分析检索,打造商品推荐体验
在电商领域,商品推荐系统是提高用户满意度与销售转化率的关键工具。本文将探讨如何利用Elasticsearch的向量检索能力,打造商品推荐体验,助力电商平台提升用户体验和业务增长。
为了充分保证集群的高可用和高性能,Elasticsearch采用至少3个节点。立即部署 60分钟 10元(假设您选择本文示例规格资源,且资源运行时间不超过60分钟。实际情况中可能会因您操作过程中实际使用的流量差异,会导致费用有所变化,请以控制台显示的实际报价以及最终账单为准)检索分析服务 Elasticsearch版 服务器 ECS ...
原生企业级数据湖
基于对象存储 OSS 构建的数据湖支持多种数据输入和存储格式,实现数据整合与分析,直接从OSS进行大数据分析以挖掘业务价值。数据湖还提供冷热数据分层和生命周期管理,优化存储成本。
结合高性能文件存储 CPFS,实现 OSS 与 CPFS 数据双向流通,同时,热点训练数据以透明方式同步到 CPFS,通过 CPFS 的文件语义与机器学习平台 PAI 对接,满足高性能训练场景需求。立即部署 80分钟 5元(假设您选择最低规格资源,且资源运行时间不超过30分钟。如调整了资源规格,请以控制台显示的实际报价以及最终账单为准)...
一键训练大模型及部署GPU共享推理服务
通过创建ACK集群Pro版,使用云原生AI套件提交模型微调训练任务与部署GPU共享推理服务。支持快速创建Kubernetes集群,白屏配置任务数据共享存储和下载,并通过命令行工具Arena快速提交模型训练任务、部署推理服务。使用云原生AI套件可以让模型训练和推理提效,提高GPU资源利用率。
实际情况可能会因您操作过程中使用的资源规格和流量差异,而导致费用有所变化,请以控制台显示的实际报价以及最终账单为准)专有网络VPC 容器服务Kubernetes版 文件存储NAS 应用背景 技术解决方案的广泛应用背景 持续优化异构资源效率 对上各种异构计算资源(如CPU、GPU、NPU、VPU、FPGA)、存储(OSS、NAS、CPFS、HDFS)...
开源大数据平台 E-MapReduce 技术解决方案
阿里云开源大数据平台 E-MapReduce 技术解决方案,帮助您快速了解如何利用这款弹性伸缩、存算分离的企业级大数据平台服务来提升业务效率,降低成本。
结合高性能文件存储 CPFS,实现 OSS 与 CPFS 数据双向流通,同时,热点训练数据以透明方式同步到 CPFS,通过 CPFS 的文件语义与机器学习平台 PAI 对接,满足高性能训练场景需求。解决问题:数据孤岛林立不同业务部门由于数据规模、数据类型不同而出现不同的数据孤岛,难以从统一位置访问和管理所有数据,数据无法实现有效...
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