高性能计算

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监控存储资源

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理>共享存储。在 共享存储 页面,选择目标集群,单击 资源 监控 页签。在 资源监控 页签下,设置并查看存储资源的相关监控数据。配置项 说明 文件...

使用HPL测试集群浮点性能

HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试,评价高性能计算集群的浮点计算能力。浮点计算峰值是指计算机每秒可以完成的浮点计算次数,包括理论浮点峰值和实测浮点峰值。理论浮点峰值是该计算机理论上每秒...

修复集群

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,选择待修复集群,单击 更多>修复。在弹出的 集群修复 页面,重新指定待修复集群的 镜像类型、镜像、调度器 和 域账号服务。...

管理作业模板

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 作业 与性能 管理>作业。在 作业 页面,选择待创建作业模板的集群。单击页面左侧的 提交作业 页签。在 提交作业 区域,完成作业参数配置,单击 图标将当前...

使用IMB软件和MPI通信库测试集群通信性能

MPI_DEBUG 5-np 2-ppn 1-host compute000,compute001/opt/intel-mpi-benchmarks/2019/IMB-MPI1 pingpong>IMB-pingpong#请根据实际调整参数 脚本示例使用2个计算节点,每个节点为8 vCPU,使用一个MPI任务进行高性能计算。实际测试中请根据...

使用VNC远程可视化

弹性高性能计算提供VNC远程可视化功能,您可以通过控制台Web方式访问远程可视化图形界面。本文介绍如何连接可视化服务和停止可视化服务。前提条件 已安装VNC服务。开启方式如下:创建新的集群时,您可以在 软件配置 页开启VNC功能,系统将...

产品规格

为更好地匹配E-HPC高性能计算特点,下文推荐了几种规格,建议您根据应用场景选择使用。关于ECS实例规格的更多信息,请参见 实例规格族 和 选型最佳实践。弹性裸金属服务器和超级计算集群(SCC)实例 如下实例无虚拟化损耗,同时提供VPC...

账单查询

查询时,筛选产品为 弹性高性能计算 可以查看E-HPC服务费的账单,您也可以筛选产品查询集群内资源的账单,例如如果想要查看集群节点资源费用,可以筛选产品为 云服务器 ECS。查询示例如下:说明 单击账单右上角的 定制列,可以选择您希望...

创建Serverless集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 集群。在 集群 页面右上角,将鼠标悬浮在 创建集群 右侧的 图标,单击 模板化创建。在 基本配置 区域,输入集群名称和登录密码。在模板区域上方,单击,...

查看E-HPC操作日志

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 运维与监控>操作日志。在 集群 列表中选择目标集群。根据需要设置查询条件,单击 图标。查询条件说明如下:查询条件 说明 时间范围 快速选择:可...

通过钉钉机器人发送事件通知

E-HPC支持的事件信息请参见 弹性高性能计算E-HPC事件。在 配置事件目标 页面,参考参数说明完成配置,单击 创建。首次操作时,需完成服务授权,允许阿里云事件总线访问审计日志。参数说明如下:服务类型:选择 钉钉。地址:填入钉钉机器人...

监控作业

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 作业与性能管理>作业。在 作业 页面,选择目标集群,单击 作业监控 页签。设置筛选条件。支持设置的筛选条件如下:时间段:过滤某一时间段内的...

创建集群

计算节点:用于执行高性能计算作业的节点,其配置决定了E-HPC集群的总体性能。管控节点:用于进行作业调度和域账号管理的节点。登录节点:默认绑定弹性公网IP,您可远程登录该节点,通过命令行操作集群。展开高级配置,配置网络、存储等...

查看集群报表

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 作业与性能管理>报表。在顶部下拉列表中,选择目标集群。查看报表。查看集群节点数量。节点数量展示集群中节点数量的变化折线图,支持显示各队列...

创建混合云集群

您可以利用本地的HPC集群在阿里云扩容计算节点资源,统一调度云上资源和您的本地资源进行高性能计算。本文介绍如何通过E-HPC管理控制台创建混合云集群。前提条件 已创建专有网络VPC和交换机。具体操作,请参见 创建专有网络 和 创建交换机...

管理共享存储

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理>共享存储。在页面上方选择目标集群,然后单击 资源管理 页签。在 资源管理 页签下,单击 挂载存储资源。在弹出面板,完成参数配置,然后单击 ...

通过命令行提交作业

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。提交作业 请根据集群...

使用AutoDock Vina软件进行药物筛选

本文以AutoDock Vina软件为例,介绍如何在E-HPC上进行高性能计算实现虚拟药物筛选。背景信息 分子对接(Molecular docking)是虚拟药物筛选中的关键环节。AutoDock Vina作为一款开源的分子对接软件,具有速度快、算法准确等优点,特别适用...

手动扩容集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到需要扩容的集群,单击 扩容。在 集群扩容 面板,完成节点配置。扩容时,支持添加新建节点、已有节点或线下节点,请根据需要选择...

通过控制台提交作业

作业指提交到E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元,包括Shell脚本、可执行文件等,具体作业执行顺序根据您设置的队列以及调度器决定。E-HPC管理控制台提供了作业相关的提交作业、停止作业、查看作业状态等功能,本文介绍如何使用E-HPC...

使用GROMACS进行分子动力学模拟

通过控制台 在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 更多>VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作,请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中,选择 Application>System Tools>Terminal。运行/...

扩容混合云集群

普通扩容 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,选择需要扩容的混合云集群,单击 扩容。在 集群扩容 面板,单击 普通扩容 页签,配置扩容参数。配置项 说明 可用区 扩容...

提交作业

作业是E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元,包括Shell脚本、可执行文件等。本文介绍如何使用E-HPC客户端提交作业。准备工作 提交作业前,您需要准备好作业文件,并上传到E-HPC集群中。E-HPC客户端支持以下两种方式上传作业文件:通过...

登录集群

规则方向 授权策略 端口范围 优先级 授权对象 入方向 允许 SSH(22)1 0.0.0.0/0 通过控制台登录 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到要登录的集群,单击 远程连接。...

设置调度器参数

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理>调度器。在 集群 列表选择目标集群,在 调度器 列表选择调度器。设置调度器配置信息,然后在页面右上角,单击 提交。Slurm 如果是Slurm调度器,...

创建带有插件的集群

使用控制台创建带有插件的集群 创建不同接入模式集群的操作如下:Image接入模式 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面右上角,单击 创建集群。根据自身业务场景进行设置,在...

常见问题

弹性高性能计算服务关联角色(AliyunServiceRoleForEHPC)是访问控制提供的一种服务关联角色,用于授权E-HPC访问关联云资源。通过AliyunServiceRoleForEHPC,E-HPC可以获得云服务器ECS、专有网络VPC、文件存储NAS等阿里云产品的访问权限。...

授权信息

本文为您介绍 弹性高性能计算(Ehpc)为RAM权限策略定义的操作(Action)、资源(Resource)和条件(Condition)。弹性高性能计算(Ehpc)的RAM代码(RamCode)为 ehpc,支持的授权粒度为 OPERATION。权限策略通用结构 权限策略支持JSON...

使用Schrodinger软件计算分子结构

在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 更多>VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作,请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中,选择 Application>System Tools>Terminal。运行/opt/vmd/1.9....

在Serverless集群中提交作业

创建Serverless集群后...在 弹性高性能计算控制台 的 作业 页面,选择目标集群后,单击 作业列表 页签。在该页面可以设置状态、时间段等条件查询作业信息。在 弹性容器实例控制台 的 容器组 页面,可以查看自动创建的用于运行作业的ECI实例。

使用向导创建集群

建议您通过弹性高性能计算管理控制台操作。步骤一:配置硬件信息 创建集群时,您必须配置集群的硬件信息。硬件决定了集群的性能,包括集群所处地域、集群部署方式、不同类型节点数量、网络类型、共享存储等。您可以根据您的业务需求选择...

混合云主控模式最佳实践

在弹性高性能计算控制台的 集群 页面,找到目标集群,单击右上角的 扩容。在弹出面板选择 线下节点 页签。选择新创建的队列,根据需要逐个录入或者批量导入线下计算节点信息,单击 确定。要录入的节点信息如下:主机名:与实际节点主机名...

使用LAMMPS软件进行工业仿真

vim lammps.pbs 作业脚本内容示例如下:说明 以下示例使用1个计算节点的32 vCPU,使用32个MPI任务进行高性能计算。请根据实际计算节点规格配置vCPU数,算力要求vCPU≥32。bin/sh#PBS-l select=1:ncpus=32:mpiprocs=32#PBS-j oe export ...

配置自动伸缩

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 弹性>自动伸缩。在 自动伸缩 页面,从集群列表中选择需要配置自动伸缩的集群。在 全局配置 区域完成参数配置。配置项 描述 开关设置 为集群内所有队列开启...

使用Intel oneAPI编译运行LAMMPS

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。步骤二:编译LAMMPS ...

API概览

本产品(弹性高性能计算/2018-04-12)的OpenAPI采用 RPC 签名风格,签名细节参见 签名机制说明。我们已经为开发者封装了常见编程语言的SDK,开发者可通过 下载SDK 直接调用本产品OpenAPI而无需关心技术细节。如果现有SDK不能满足使用需求,...

客户端功能概述

作业操作员 负责提交作业到E-HPC集群进行高性能计算。E-HPC客户端主要面向作业操作员,支持作业提交、作业文件管理等功能。具体功能如下:功能模块 说明 作业查询 支持按多种条件查询作业数据,以便调整作业任务。作业提交 支持通过界面、...

使用Environment Modules管理软件包

module load:加载模块 module unload:卸载模块 module list:显示已经加载的模块 操作步骤 以下通过Environment Modules软件卸载openmpi/3.0.0,然后加载openmpi/3.0.1版本示例来介绍如何设置modulefile:登录 弹性高性能计算控制台。...

配置集群巡检

配置集群巡检 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 运维与监控>集群巡检。在集群列表中选择目标集群,然后单击 创建巡检。在弹出的对话框中,完成巡检配置。输入名称和描述。选择巡检执行方式...

使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。步骤二:运行算例 ...
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