高性能科学计算

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Gromacs Ehpc计算巢快速部署文档

AliyunComputeNestUserFullAccess 管理计算巢服务(ComputeNest)的用户侧权限 计费说明 Gromacs社区版在计算巢部署的费用主要涉及:弹性高性能计算集群(EHPC)费用。文件系统(NAS)费用。流量带宽费用。部署架构 由一个ehpc集群组成,...

AutoDock Vina Ehpc计算巢部署文档

AliyunComputeNestUserFullAccess 管理计算巢服务(ComputeNest)的用户侧权限 计费说明 AutoDock Vina社区版在计算巢部署的费用主要涉及:弹性高性能计算集群(EHPC)费用 文件系统(NAS)费用 流量带宽费用 部署架构 部署由一个ehpc集群...

MemVerge服务计算巢模式部署文档

权限策略名称 备注 AliyunNASFullAccess 管理文件存储服务(NAS)的权限 AliyunECSFullAccess 管理云服务器服务(ECS)的权限 AliyunVPCFullAccess 管理专有网络(VPC)的权限 AliyunEHPCFullAccess 管理弹性高性能计算(EHPC)的权限 授予...

监控作业

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 作业与性能管理 作业。在 作业 页面,选择目标集群,单击 作业监控 页签。设置筛选条件。支持设置的筛选条件如下:时间段:过滤某一时间段内的...

使用HPL测试集群浮点性能

HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试,评价高性能计算集群的浮点计算能力。浮点计算峰值是指计算机每秒可以完成的浮点计算次数,包括理论浮点峰值和实测浮点峰值。理论浮点峰值是该计算机理论上每秒...

LAMMPS Ehpc服务实例部署文档

AliyunComputeNestUserFullAccess 管理计算巢服务(ComputeNest)的用户侧权限 计费说明 LAMMPS社区版在计算巢部署的费用主要涉及:弹性高性能计算集群(EHPC)费用 文件系统(NAS)费用 流量带宽费用 部署架构 服务实例由一个EHPC集群组成...

AlphaFold2 Ehpc计算巢快速部署文档

AliyunComputeNestUserFullAccess 管理计算巢服务(ComputeNest)的用户侧权限 计费说明 AlphaFold2社区版在计算巢部署的费用主要涉及:弹性高性能计算集群(EHPC)费用 文件系统(NAS)费用 流量带宽费用 部署架构 部署由一个ehpc集群组成...

查看集群报表

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 作业与性能管理 报表。在顶部下拉列表中,选择目标集群。查看报表。查看集群节点数量。节点数量展示集群中节点数量的变化折线图,支持显示各队列...

使用HPL测试集群浮点性能

HPL通过对高性能计算集群采用高斯消元法求解一元N次稠密线性代数方程组的测试,评价高性能计算集群的浮点计算能力。浮点计算峰值是指计算机每秒可以完成的浮点计算次数,包括理论浮点峰值和实测浮点峰值。理论浮点峰值是该计算机理论上每秒...

创建带有插件的集群

使用控制台创建带有插件的集群 创建不同接入模式集群的操作如下:Image接入模式 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面右上角,单击 创建集群。根据自身业务场景进行设置,在...

功能特性

弹性高性能计算集群 自动化创建和管理HPC集群,提供常见的HPC调度器,支持公共云部署和线下集群Cloud Busrting能力。功能集 功能 功能描述 参考文档 集群管理 队列管理 提供集群队列功能,用于划分计算资源,调度用户作业,以及管理用户...

创建混合云集群

您可以利用本地的HPC集群在阿里云扩容计算节点资源,统一调度云上资源和您的本地资源进行高性能计算。本文介绍如何通过E-HPC管理控制台创建混合云集群。前提条件 已创建专有网络VPC和交换机。具体操作,请参见 创建专有网络 和 创建交换机...

使用LAMMPS软件进行工业仿真

E-HPC作为高性能且弹性的计算集群,可为复杂工程和力学结构提供辅助分析,通过大量数据仿真模拟优化产品结构和性能,目前在工业仿真领域的应用越来越多。准备工作 创建E-HPC集群。具体操作,请参见 使用向导创建集群。配置集群时,本文使用...

创建集群

计算节点:用于执行高性能计算作业的节点,其配置决定了E-HPC集群的总体性能。管控节点:用于进行作业调度和域账号管理的节点。登录节点:默认绑定弹性公网IP,您可远程登录该节点,通过命令行操作集群。展开高级配置,配置网络、存储等...

SDK概述

本文为您介绍了E-HPC Instant计算...{endpoint}:弹性高性能计算的服务地址。更多信息,请参见 服务接入点。{accessKeyId} 和${accessKeySecret}:您的访问密钥信息,需登录 RAM控制台 查看。具体步骤,请参见 查看RAM用户的AccessKey信息。

账单查询

在 账单详情 页面,统计项 选择 计费项 或 实例,统计周期 设置为 明细,产品名称 选择 弹性高性能计算,商品名称 选择 E-HPC Instant 计算服务,单击 搜索。说明 您可以单击账单右上角的 图标,在弹出的 定制列 对话框中,选择您希望展示...

伸缩集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,找到待操作的集群,单击 自动伸缩。在弹出的 集群自动伸缩 对话框中,完成 集群全局配置 区域的参数配置。配置项 说明 开关设置 ...

日志

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,选择 运维管理 日志。根据需要设置查询条件,然后单击 图标。查询条件说明如下:查询条件 ...

使用IMB软件和MPI通信库测试集群通信性能

MPI(Message Passing Interface)是支持多编程语言编程的并行计算通信库,具有高性能、大规模性、可移植性、可扩展性等特点。准备工作 创建一个E-HPC集群。具体操作,请参见 使用向导创建集群。配置集群时,软硬件参数配置如下:参数 说明...

实例规格选型指导

场景分类 场景细分 推荐规格族 性能需求 处理器与内存比 通用应用 均衡性能应用,后台应用 g系列,如g7 中主频,计算密集型 1:4 高网络收发包应用 g系列,如g7 高网络PPS,计算密集型 1:4 高性能计算 hfc系列,如hfc7 高主频,计算密集型 1...

登录E-HPC Portal

在 弹性高性能计算控制台 的新版 集群 页面找到目标集群,在 自定义服务组件 区域,单击 Web Portal 即可打开E-HPC Portal登录页面。说明 如果您使用旧版控制台,可在 集群 页面的右上角单击 体验新版 切换到新版控制台。方式二:打开浏览...

通过配置工业仿真软件支持eRDMA以提升仿真效率

此外,它还支持与RDMA技术相关的通信库(如DAPL、OpenFabrics等),这使得它能够在高性能计算环境中做到无缝集成,并确保良好的通信性能。具体支持情况如下:MPI库 通过DAPL提供对eRDMA的支持 通过OFI提供对eRDMA的支持 Intel MPI 2017、...

登录集群

规则方向 授权策略 端口范围 优先级 授权对象 入方向 允许 SSH(22)1 0.0.0.0/0 通过控制台登录 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到要登录的集群,单击 远程连接。...

使用GROMACS进行分子动力学模拟

通过控制台 在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 更多 VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作,请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中,选择 Application System Tools Terminal。运行/...

E-HPC Portal功能概述

集群管理员 负责部署和管理E-HPC集群,通常使用弹性高性能计算控制台进行操作,包括创建和配置集群、扩容节点、管理集群用户等。作业操作员 负责提交作业到E-HPC集群进行高性能计算,建议使用E-HPC Portal进行操作,包括上传作业文件,提交...

连接集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击右上角的 远程连接。说明 您也可以在 自定义服务组件 区域的 登录节点 处,单击 SSH,以快速连接登录节点。在弹出...

通过控制台提交作业

作业指提交到E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元,包括Shell脚本、可执行文件等,具体作业执行顺序根据您设置的队列以及调度器决定。E-HPC管理控制台提供了作业相关的提交作业、停止作业、查看作业状态等功能,本文介绍如何使用E-HPC...

产品计费

该集群提供高性能计算资源,适用于对计算性能要求较高的应用场景 计算资源[1000LCU,500000LCU]存储容量[10GB,500GB]1000LCU,10GB 0.49 0.0094 0.605 独享集群-存储型 您购买的集群资源独立部署,不与任何用户共用。该集群提供大规格存储...

队列

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,选择 节点与队列 队列。单击 创建队列,在 创建队列 页面填写对应参数。配置项说明如下:基本...

【下线公告】批量计算产品下线及迁移说明

非常感谢您对阿里云批量计算产品的支持,为了更好提升产品技术和服务体验,阿里云批量计算原有功能将与阿里云弹性高性能计算合并,通过E-HPC INSTANT 计算服务为用户提供更加简单易用、经济高效的智能批处理服务。阿里云计划于2025年5月15...

创建作业

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在 集群 页面,找到gromacs-test集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入gmx.test的用户名、密码和节点端口,单击 ssh连接。下载并解压算例。说明 本算例为模拟...

通过钉钉机器人发送事件通知

温馨提醒您的账户于${createTime} 在${regionId} 地域在弹性高性能计算集群${clusterName}(${clusterId})上进行节点扩容,操作信息如下:\t可用区ID:${zoneId} \t交换机ID:${vSwitchId} \t镜像ID:${imageId} \t实例类型:${instanceType...

管理共享存储

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理 共享存储。在页面上方选择目标集群,然后单击 资源管理 页签。在 资源管理 页签下,单击 挂载存储资源。在弹出面板,完成参数配置,然后单击 ...

使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。步骤二:运行算例 ...

API概览

本产品(弹性高性能计算/2024-07-30)的OpenAPI采用 RPC 签名风格,签名细节参见 签名机制说明。我们已经为开发者封装了常见编程语言的SDK,开发者可通过 下载SDK 直接调用本产品OpenAPI而无需关心技术细节。如果现有SDK不能满足使用需求,...

存储概述

AI训练、基因计算高性能计算场景 CPFS通用版具有高吞吐和高IOPS,能够满足HPC高性能计算场景的需求,如AI训练、自动驾驶、基因计算、影视渲染等业务。您可以结合CPFS通用版的费用、性能等选择合适的规格。更多信息,请参见 产品规格。CPFS...

创建Serverless集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 集群。在 集群 页面右上角,将鼠标悬浮在 创建集群 右侧的 图标,单击 模板化创建。在 基本配置 区域,输入集群名称和登录密码。在模板区域上方,单击,...

Alphafold3结合Afusion的蛋白质结构预测实践

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击 集群模板。在弹出的对话框中,选择 Alphafold3。集群环境软件与硬件默认配置 OS:Ubuntu 22.04 ECS实例:4vcpu 8GB,40GB...

调度概述

高性能计算、AI训练等任务,应用需要所有副本都启动才能运行,如MPI任务。使用Gang Scheduling Capacity Scheduling 允许集群为特定的命名空间设定资源容量限制。多个用户或应用共享集群,需要按命名空间限制资源使用。使用Capacity ...

在Serverless集群中提交作业

创建Serverless集群后...在 弹性高性能计算控制台 的 作业 页面,选择目标集群后,单击 作业列表 页签。在该页面可以设置状态、时间段等条件查询作业信息。在 弹性容器实例控制台 的 容器组 页面,可以查看自动创建的用于运行作业的ECI实例。
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