本文以在E-HPC集群中使用GROMACS软件运行水分子算例进行高性能计算为例,介绍如何利用E-HPC Portal快速运行作业。更多关于E-HPC Portal信息,请参见 E-HPC Portal功能概述。准备工作 已创建服务关联角色。首次登录E-HPC控制台,系统会提示...
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,选择 节点与队列 节点。单击 预设节点池,在 新增预设节点池 页面配置以下参数。参数 说明 ...
规则方向 授权策略 端口范围 优先级 授权对象 入方向 允许 SSH(22)1 0.0.0.0/0 通过控制台登录 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到要登录的集群,单击 远程连接。...
作业操作员 负责提交作业到E-HPC集群进行高性能计算,建议使用E-HPC Portal进行操作,包括上传作业文件,提交作业等。主页 登录E-HPC Portal 后默认进入Portal主页,如下图所示:主页包括以下几部分:最近访问:显示最近访问过的应用,便于...
作业是E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元,包括Shell脚本、可执行文件等。本文介绍如何使用E-HPC客户端提交作业。准备工作 提交作业前,您需要准备好作业文件,并上传到E-HPC集群中。E-HPC客户端支持以下两种方式上传作业文件:通过...
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,单击 作业管理。单击 创建作业,并完成以下参数配置。基本设置 参数项 是否必选 说明 作业...
vim lammps.pbs 作业脚本内容示例如下:说明 以下示例使用1个计算节点的32 vCPU,使用32个MPI任务进行高性能计算。请根据实际计算节点规格配置vCPU数,算力要求vCPU≥32。bin/sh#PBS-l select=1:ncpus=32:mpiprocs=32#PBS-j oe export ...
module load:加载模块 module unload:卸载模块 module list:显示已经加载的模块 操作步骤 以下通过Environment Modules软件卸载openmpi/3.0.0,然后加载openmpi/3.0.1版本示例来介绍如何设置modulefile:登录 弹性高性能计算控制台。...
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,选择 运维管理 监控。根据需要,单击对应页签,以查看E-HPC的监控信息。说明 当您查看节点...
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击 集群模板。在弹出的对话框中,选择 Alphafold3。集群环境软件与硬件默认配置 OS:Ubuntu 22.04 ECS实例:4vcpu 8GB,40GB...
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。提交作业 请根据集群...
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。步骤二:运行算例 ...
背景信息 CPFS(Cloud Paralleled File System)是一种高性能并行文件存储系统,专为AI训练和E-HPC等高性能计算场景打造,最大支持数十GB/s吞吐能力。CPFS的数据存储在集群中的多个数据节点,并可由多个客户端同时访问,从而能够为大型E-...
登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理 调度器。在 集群 列表选择目标集群,在 调度器 列表选择调度器。设置调度器配置信息,然后在页面右上角,单击 提交。Slurm 如果是Slurm调度器,...
步骤四:配置集群自动伸缩 登录 弹性高性能计算控制台。单击目标 集群名称,进入 集群详情 页面。在左侧导航栏,选择 节点与队列 队列,单击目标队列 操作 列下的 编辑。在 编辑队列 页面,完成 实例规格组 的参数配置。更多内容,请参见 ...
弹性高性能计算E-HPC(ElasticHigh Performance Computing)是阿里云提供的性能卓越、稳定可靠、弹性扩展的高性能计算服务。弹性高性能计算将计算能力积聚,用并行计算方式解决更大规模的科学、工程和商业问题,在科研机构、石油勘探、金融...
修改RAM用户的控制台权限 默认情况下,RAM用户具有弹性高性能计算控制台的所有页面的访问权限,控制台左侧导航栏将显示全部功能菜单项。修改RAM用户的控制台权限功能可以控制RAM用户访问弹性高性能计算控制台时,左侧导航栏的菜单项显示。...
通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。步骤二:编译LAMMPS ...
高性能计算可以提供强大的算力支持,使用多种调度器提高并发效率,使用GPU进行计算加速等。本文以经典及普及的二代全基因组测序WGS(Whole Genome Sequencing)流程为例,结合二代测序软件GATK,介绍人类全基因组测序的通用流程。在实际...
泓博医药执行副总裁蔡振伟表示:“深势科技的Hermite®平台加上阿里云高性能计算E-HPC集群,大幅提升了泓博医药分子模拟效率,降低了泓博医药的合成成本,也减少了定制合成的等待时间,大大缩短管线推进到临床候选化合物的时间。...
采用最新一代阿里云高性能计算和存储基础设施,客户使用成本大幅下降。云原生 的计算和存储分离架构,一写多读,灵活弹性,配置升降级和增加节点分钟级生效。多个计算节点共享存储,新增只读节点时只需支付计算节点费用,大大降低了扩容...
您可以利用本地的HPC集群在阿里云扩容计算节点资源,统一调度云上资源和您的本地资源进行高性能计算。本文介绍如何通过E-HPC管理控制台创建混合云集群。前提条件 已创建专有网络VPC和交换机。具体操作,请参见 创建专有网络 和 创建交换机...
本文介绍如何通过弹性高性能计算控制台安装和卸载集群的自定义服务。前提条件 集群状态处于 运行中。集群类型为以下几种:公共云标准版集群 公共云托管版集群 添加自定义服务 进入 集群详情 页面。登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏...
集群是运行高性能计算的节点集合,可以提供单节点不能提供的强大计算能力,拥有高性能、弹性扩展、稳定可靠等优点。本文介绍集群的定义、E-HPC支持的集群类型和组成部分,以及集群相关的功能。支持的集群 类型 E-HPC集群根据部署环境、集群...
灵骏是一种大规模高密度计算服务,全称“智能计算灵骏”,提供高性能AI训练、高性能计算所需的异构计算算力服务。
弹性高性能计算集群 自动化创建和管理HPC集群,提供常见的HPC调度器,支持公共云部署和线下集群Cloud Busrting能力。功能集 功能 功能描述 参考文档 集群管理 队列管理 提供集群队列功能,用于划分计算资源,调度用户作业,以及管理用户...
本文为您介绍 弹性高性能计算(EhpcInstant)为RAM权限策略定义的操作(Action)、资源(Resource)和条件(Condition)。弹性高性能计算(EhpcInstant)的RAM代码(RamCode)为 ehpc,支持的授权粒度为 操作级。权限策略通用结构 权限策略...
本文为您介绍 弹性高性能计算(EHPC)为RAM权限策略定义的操作(Action)、资源(Resource)和条件(Condition)。弹性高性能计算(EHPC)的RAM代码(RamCode)为 ehpc,支持的授权粒度为 操作级。权限策略通用结构 权限策略支持JSON格式,...
弹性高性能计算服务关联角色(AliyunServiceRoleForEHPC)是访问控制提供的一种服务关联角色,用于授权E-HPC访问关联云资源。通过AliyunServiceRoleForEHPC,E-HPC可以获得云服务器ECS、专有网络VPC、文件存储NAS等阿里云产品的访问权限。...
本教程详解如何在阿里云E-HPC中接入自定义调度器,通过分步指导您构建插件、创建集群,并提供核心API说明,助您快速实现灵活的高性能计算任务调度。
使用弹性高性能计算的SDK可以更加便捷地执行创建集群、管理集群、提交作业等操作,开发者只需专注于业务逻辑的实现,无需关注底层的操作和维护。本文介绍弹性高性能计算SDK使用说明。SDK列表 本文以Java和Python 3为例。关于E-HPC其它语言...
高性能云盘是RDS PostgreSQL支持的一种新存储类型。在基本兼容ESSD云盘所有特性的基础上,高性能云盘支持IO性能突发、Buffer Pool Extension(BPE)和数据归档能力。本文介绍如何将ESSD云盘类型的实例存储类型变更为高性能云盘。前提条件 ...
本文介绍弹性高性能计算产品功能和对应的文档动态。2023年 2023年9月 功能名称 变更类型 功能描述 发布时间 相关文档 通过Serverless集群提交作业 新增 Serverless集群的计算节点由ECI实例组成,您只需提供打包好的容器镜像,即可使用ECI...
相关文档与API 什么是高性能云盘 开启高性能云盘的Buffer Pool Extension(BPE)功能 开启高性能云盘的IO性能突发功能 开启高性能云盘的数据归档功能 相关API 通过API(ModifyDBInstanceSpec)将ESSD云盘变更为高性能云盘:请确认实例的原...
SCC与阿里云ECS、GPU云服务器等计算类产品一起,为 阿里云弹性高性能计算平台E-HPC 提供了极高性能的并行计算资源,实现真正的云上超算。高性能计算优化型包含以下规格族:通用型超级计算集群实例规格族sccg7 计算型超级计算集群实例规格族...
本文为您介绍了E-HPC Instant计算...{endpoint}:弹性高性能计算的服务地址。更多信息,请参见 服务接入点。{accessKeyId} 和${accessKeySecret}:您的访问密钥信息,需登录 RAM控制台 查看。具体步骤,请参见 查看RAM用户的AccessKey信息。
为应对多样化存储需求及资源性能限制,推荐使用RDS PostgreSQL高性能云盘(新型存储类型)。本文介绍其性能特点、适用场景及计费方式,助您快速部署。功能简介 高性能云盘是RDS PostgreSQL支持的一种新存储类型。在基本兼容ESSD云盘所有...
通过AliyunECSInstanceForEHPCRole,ECS实例可以获得云服务器ECS、弹性高性能计算E-HPC的访问权限。RAM用户使用普通服务角色需要的权限 如果使用RAM用户创建或删除普通服务角色,必须使用阿里云账号为该RAM用户授权。方式一:授予...
高性能云盘是RDS SQL Server支持的一种新型存储类型,在兼容ESSD云盘 所有特性(暂停实例 功能除外)基础上,新增 IO性能突发 功能,可在业务高峰期提供更高IOPS和QPS性能,满足波动性IO需求。本文将介绍高性能云盘的主要特性以及使用方法...
高性能云盘是RDS SQL Server支持的一种新型存储类型,在兼容ESSD云盘 所有特性(暂停实例 功能除外)基础上,新增 IO性能突发 功能,可在业务高峰期提供更高IOPS和QPS性能,满足波动性IO需求。本文将介绍高性能云盘的主要特性以及使用方法...