高性能计算架构

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SDK概述

本文为您介绍了E-HPC Instant计算...{endpoint}:弹性高性能计算的服务地址。更多信息,请参见 服务接入点。{accessKeyId} 和${accessKeySecret}:您的访问密钥信息,需登录 RAM控制台 查看。具体步骤,请参见 查看RAM用户的AccessKey信息。

伸缩集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,找到待操作的集群,单击 自动伸缩。在弹出的 集群自动伸缩 对话框中,完成 集群全局配置 区域的参数配置。配置项 说明 开关设置 ...

日志

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,选择 运维管理 日志。根据需要设置查询条件,然后单击 图标。查询条件说明如下:查询条件 ...

登录E-HPC Portal

在 弹性高性能计算控制台 的新版 集群 页面找到目标集群,在 自定义服务组件 区域,单击 Web Portal 即可打开E-HPC Portal登录页面。说明 如果您使用旧版控制台,可在 集群 页面的右上角单击 体验新版 切换到新版控制台。方式二:打开浏览...

E-HPC Portal功能概述

作业操作员 负责提交作业到E-HPC集群进行高性能计算,建议使用E-HPC Portal进行操作,包括上传作业文件,提交作业等。主页 登录E-HPC Portal 后默认进入Portal主页,如下图所示:主页包括以下几部分:最近访问:显示最近访问过的应用,便于...

登录集群

规则方向 授权策略 端口范围 优先级 授权对象 入方向 允许 SSH(22)1 0.0.0.0/0 通过控制台登录 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到要登录的集群,单击 远程连接。...

使用LAMMPS软件进行工业仿真

vim lammps.pbs 作业脚本内容示例如下:说明 以下示例使用1个计算节点的32 vCPU,使用32个MPI任务进行高性能计算。请根据实际计算节点规格配置vCPU数,算力要求vCPU≥32。bin/sh#PBS-l select=1:ncpus=32:mpiprocs=32#PBS-j oe export ...

连接集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击右上角的 远程连接。说明 您也可以在 自定义服务组件 区域的 登录节点 处,单击 SSH,以快速连接登录节点。在弹出...

通过控制台提交作业

作业指提交到E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元,包括Shell脚本、可执行文件等,具体作业执行顺序根据您设置的队列以及调度器决定。E-HPC管理控制台提供了作业相关的提交作业、停止作业、查看作业状态等功能,本文介绍如何使用E-HPC...

使用GROMACS进行分子动力学模拟

通过控制台 在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 更多 VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作,请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中,选择 Application System Tools Terminal。运行/...

使用IMB软件和MPI通信库测试集群通信性能

MPI_DEBUG 5-np 2-ppn 1-host compute000,compute001/opt/intel-mpi-benchmarks/2019/IMB-MPI1 pingpong IMB-pingpong#请根据实际调整参数 脚本示例使用2个计算节点,每个节点为8 vCPU,使用一个MPI任务进行高性能计算。实际测试中请根据...

基于eRDMA部署弹性高性能计算集群

OSU-Benchmark测试 OSU-Benchmark用于评估高性能计算HPC)集群和分布式系统的通信性能。本文利用以下2个基准测试,基于不同网络协议(TCP vs.RDMA)测试通信性能:网络延迟测试(osu_latency):测量点对点通信的单向延迟(从进程A发送...

创建作业

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在 集群 页面,找到gromacs-test集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入gmx.test的用户名、密码和节点端口,单击 ssh连接。下载并解压算例。说明 本算例为模拟...

队列

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,选择 节点与队列 队列。单击 创建队列,在 创建队列 页面填写对应参数。配置项说明如下:基本...

通过钉钉机器人发送事件通知

E-HPC支持的事件信息请参见 弹性高性能计算E-HPC事件。在 配置事件目标 页面,参考参数说明完成配置,单击 创建。首次操作时,需完成服务授权,允许阿里云事件总线访问审计日志。参数说明如下:服务类型:选择 钉钉。地址:填入钉钉机器人...

通过配置工业仿真软件支持eRDMA以提升仿真效率

此外,它还支持与RDMA技术相关的通信库(如DAPL、OpenFabrics等),这使得它能够在高性能计算环境中做到无缝集成,并确保良好的通信性能。具体支持情况如下:MPI库 通过DAPL提供对eRDMA的支持 通过OFI提供对eRDMA的支持 Intel MPI 2017、...

产品规格

为更好地匹配E-HPC高性能计算特点,下文推荐了几种规格,建议您根据应用场景选择使用。关于ECS实例规格的更多信息,请参见 实例规格族 和 选型最佳实践。弹性裸金属服务器和超级计算集群(SCC)实例 如下实例无虚拟化损耗,同时提供VPC...

管理共享存储

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理 共享存储。在页面上方选择目标集群,然后单击 资源管理 页签。在 资源管理 页签下,单击 挂载存储资源。在弹出面板,完成参数配置,然后单击 ...

集群概述

集群指运行高性能计算的节点集合,可以提供单节点不能提供的强大计算能力,拥有高性能、弹性扩展、稳定可靠等优点。本文介绍集群涉及的基本概念和功能。节点 E-HPC集群中的每个节点是一台ECS实例。按节点功能分类,可以分为登录节点、管控...

API概览

本产品(弹性高性能计算/2024-07-30)的OpenAPI采用 RPC 签名风格,签名细节参见 签名机制说明。我们已经为开发者封装了常见编程语言的SDK,开发者可通过 下载SDK 直接调用本产品OpenAPI而无需关心技术细节。如果现有SDK不能满足使用需求,...

使用OpenFOAM软件进行流体力学仿真计算

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。步骤二:运行算例 ...

创建Serverless集群

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 集群。在 集群 页面右上角,将鼠标悬浮在 创建集群 右侧的 图标,单击 模板化创建。在 基本配置 区域,输入集群名称和登录密码。在模板区域上方,单击,...

提交作业

作业是E-HPC集群进行高性能计算的基本工作单元,包括Shell脚本、可执行文件等。本文介绍如何使用E-HPC客户端提交作业。准备工作 提交作业前,您需要准备好作业文件,并上传到E-HPC集群中。E-HPC客户端支持以下两种方式上传作业文件:通过...

客户端功能概述

作业操作员 负责提交作业到E-HPC集群进行高性能计算。E-HPC客户端主要面向作业操作员,支持作业提交、作业文件管理等功能。具体功能如下:功能模块 说明 作业查询 支持按多种条件查询作业数据,以便调整作业任务。作业提交 支持通过界面、...

E-HPC普通服务角色

通过AliyunECSInstanceForEHPCRole,ECS实例可以获得云服务器ECS、弹性高性能计算E-HPC的访问权限。RAM用户使用普通服务角色需要的权限 如果使用RAM用户创建或删除普通服务角色,必须使用阿里云账号为该RAM用户授权。方式一:授予...

E-HPC普通服务角色

通过AliyunECSInstanceForEHPCRole,ECS实例可以获得云服务器ECS、弹性高性能计算E-HPC的访问权限。RAM用户使用普通服务角色需要的权限 如果使用RAM用户创建或删除普通服务角色,必须使用阿里云账号为该RAM用户授权。方式一:授予...

设置调度器参数

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理 调度器。在 集群 列表选择目标集群,在 调度器 列表选择调度器。设置调度器配置信息,然后在页面右上角,单击 提交。Slurm 如果是Slurm调度器,...

使用Environment Modules管理软件包

module load:加载模块 module unload:卸载模块 module list:显示已经加载的模块 操作步骤 以下通过Environment Modules软件卸载openmpi/3.0.0,然后加载openmpi/3.0.1版本示例来介绍如何设置modulefile:登录 弹性高性能计算控制台。...

通过命令行提交作业

通过控制台 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 远程连接。在 远程连接 页面,输入集群用户名、登录密码和端口,单击 ssh连接。提交作业 请根据集群...

提交作业

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,单击 作业管理。单击 创建作业,并完成以下参数配置。基本设置 参数项 是否必选 说明 作业...

管理节点

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 资源管理 节点与队列。在 集群 列表中选择目标集群,在 节点类型 列表中选择要操作的节点类型,然后按照需要进行操作。说明 不同类型节点支持的操作不同...

使用向导创建集群

建议您通过弹性高性能计算管理控制台操作。步骤一:配置硬件信息 创建集群时,您必须配置集群的硬件信息。硬件决定了集群的性能,包括集群所处地域、集群部署方式、不同类型节点数量、网络类型、共享存储等。您可以根据您的业务需求选择...

查看监控信息

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,单击目标 集群名称。在左侧导航栏,选择 运维管理 监控。根据需要,单击对应页签,以查看E-HPC的监控信息。说明 当您查看节点...

通过MemVerge Memory Machine扩展内存

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面右上角,单击 创建集群。在 硬件配置 页,完成硬件配置,然后单击 下一步。配置硬件时,由于Memory Machine基于Intel Optane PMEM,...

使用Schrodinger软件计算分子结构

在 弹性高性能计算控制台 的左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,找到目标集群,单击 更多 VNC。使用VNC远程连接可视化服务。具体操作,请参见 连接可视化服务。在VNC窗口中,选择 Application System Tools Terminal。运行/opt/vmd/1.9....

扩容混合云集群

操作步骤 登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群 页面,选择需要扩容的混合云集群,单击 扩容。选择扩容方式,配置扩容参数。重要 不同类型的集群,显示的扩容方式不一样,扩容时...

常见问题

弹性高性能计算服务关联角色(AliyunServiceRoleForEHPC)是访问控制提供的一种服务关联角色,用于授权E-HPC访问关联云资源。通过AliyunServiceRoleForEHPC,E-HPC可以获得云服务器ECS、专有网络VPC、文件存储NAS等阿里云产品的访问权限。...

自动伸缩节点

登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,单击 集群。在 集群列表 页面,找到待操作的集群,单击 自动伸缩。在弹出的 集群自动伸缩 对话框中,完成 集群全局配置 区域的参数配置。配置项 说明 自动扩容/...

使用模板创建集群

建议您通过弹性高性能计算管理控制台操作。操作步骤 打开模板化配置页面。登录 弹性高性能计算控制台。在顶部菜单栏左上角处,选择地域。在左侧导航栏,选择 集群。在 集群 页面右上角,将鼠标悬浮在 创建集群 右侧的 图标,单击 模板化...

创建标准版集群

建议您通过 弹性高性能计算控制台 操作。更多关于E-HPC集群的相关信息,请参见 集群概述。前提条件 已创建服务关联角色。首次登录E-HPC控制台,系统会提示您创建E-HPC服务关联角色。已创建专有网络VPC和交换机。具体操作,请参见 创建专有...
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